More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0135 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  100 
 
 		 319 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  55.52 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  56.29 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  55.96 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  55.48 
 
 		 320 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  55.48 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  55.3 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  51.67 
 
 		 346 aa  348  8e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  53.8 
 
 		 350 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  53.64 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  50.16 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  55.45 
 
 		 373 aa  342  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  55.45 
 
 		 373 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  51.32 
 
 		 340 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  50.32 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  48.69 
 
 		 383 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  49.83 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  48.37 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  51.83 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  49.84 
 
 		 358 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  50.16 
 
 		 358 aa  331  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  50.97 
 
 		 353 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  48.52 
 
 		 341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  50 
 
 		 353 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  50 
 
 		 353 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  50 
 
 		 353 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  53.67 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  54 
 
 		 348 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  53.67 
 
 		 347 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  53.67 
 
 		 347 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  48.85 
 
 		 359 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  49.01 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  48.85 
 
 		 365 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  48.85 
 
 		 365 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  48.85 
 
 		 365 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  47.5 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  46.47 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  49.53 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  51.97 
 
 		 347 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  51.97 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  50.66 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.16 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  52.3 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  50.17 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  51.68 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  48.54 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  51.68 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  51.34 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  51.01 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  51.01 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  51.34 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  49.02 
 
 		 330 aa  311  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  49.01 
 
 		 330 aa  311  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  47.71 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  48.52 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  49.17 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  50.67 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  48.48 
 
 		 319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  47.08 
 
 		 340 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  48.18 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  46.2 
 
 		 319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  48.18 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  50.33 
 
 		 342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  48.84 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  47.35 
 
 		 312 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.59 
 
 		 323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.59 
 
 		 323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  44.59 
 
 		 323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  44.59 
 
 		 323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  44.59 
 
 		 323 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  48.99 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  48.66 
 
 		 312 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  44.04 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  46.91 
 
 		 332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  46.05 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  45.1 
 
 		 333 aa  295  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  47.49 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  46.8 
 
 		 320 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  46.71 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  50.34 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  46.43 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  47.45 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  46.38 
 
 		 339 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  45.48 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  42.62 
 
 		 319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  42.81 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  42.95 
 
 		 319 aa  282  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 		 312 aa  282  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  44.85 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  46.23 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  43.22 
 
 		 346 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  43.38 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  44.7 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1389  glycosyl transferase  42.53 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.776961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.11 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1339  glycosyl transferase family 2  45.75 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  40.26 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>