114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0123 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  38.73 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  39.46 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  45.56 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  42.39 
 
 		 214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  44.38 
 
 		 195 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  37.88 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  36.67 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  36.67 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  38.03 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  38.95 
 
 		 197 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  36.19 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  43.69 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  39.36 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  40.12 
 
 		 204 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  40.35 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  39.89 
 
 		 196 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  43.71 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  36.71 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  41.62 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  38.25 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  40.54 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  39.88 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  35.82 
 
 		 266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  39.66 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  39.88 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  33.33 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  33.52 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  40.37 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  35.61 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  34.85 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  34.85 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.07 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  30.82 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  32.33 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  31.45 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.94 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  27.78 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.28 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  33.33 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  35.54 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  30.94 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.28 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  31.54 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.5 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.5 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.5 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  31.5 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  29.41 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  30.46 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  31.02 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  44.29 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  26.64 
 
 		 556 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  29.93 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  32 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  26.4 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  34.07 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  29.75 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  35.2 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  30.94 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.63 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  34.65 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  29.63 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  31.72 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  37.37 
 
 		 328 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  33 
 
 		 353 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  30.88 
 
 		 365 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.21 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  30.43 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  29.85 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  29.09 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  26.87 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  27.75 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  22.37 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  27.54 
 
 		 293 aa  49.3  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  29.71 
 
 		 339 aa  49.3  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  30.51 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  24 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  28.3 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  25.35 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  29.29 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  27.36 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  30.16 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  29.63 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  29.5 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  30.91 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  29.49 
 
 		 352 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  23.56 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  20.67 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  24.29 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.15 
 
 		 336 aa  46.2  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  27.61 
 
 		 305 aa  45.8  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  23.2 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  21.97 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  27.94 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  30.36 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  30.43 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  26.62 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  35.71 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>