37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0098 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  100 
 
 		 1214 aa  2526    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  29.05 
 
 		 1228 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  21.8 
 
 		 1109 aa  151  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  23.19 
 
 		 1159 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  22.33 
 
 		 1207 aa  112  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  21.72 
 
 		 1113 aa  113  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1141 aa  105  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1140 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  22.51 
 
 		 1107 aa  101  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  22.3 
 
 		 1159 aa  79.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1159 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1159 aa  66.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1145 aa  66.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  26.13 
 
 		 1124 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1143 aa  61.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1144 aa  60.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1123 aa  58.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1122 aa  58.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  22.7 
 
 		 1093 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1138 aa  57.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1166 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1121 aa  54.3  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1121 aa  53.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  25.39 
 
 		 1140 aa  53.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1133 aa  53.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1125 aa  53.5  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  30.87 
 
 		 1133 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1121 aa  53.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1125 aa  52.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  25 
 
 		 1121 aa  52  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1121 aa  49.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1151 aa  48.9  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  28.46 
 
 		 1130 aa  46.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2543  hypothetical protein  28.25 
 
 		 936 aa  46.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.14 
 
 		 519 aa  46.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2446  hypothetical protein  28.25 
 
 		 778 aa  45.8  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  47.83 
 
 		 377 aa  45.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>