16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0088 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  23.56 
 
 
281 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  20.86 
 
 
285 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  20.86 
 
 
285 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  20.79 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  21.81 
 
 
336 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  24.1 
 
 
300 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  23.42 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  24.29 
 
 
283 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  23.35 
 
 
299 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  21.94 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  23.7 
 
 
319 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  27.27 
 
 
328 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  26.42 
 
 
299 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  27.83 
 
 
298 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  23.24 
 
 
303 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>