126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0065 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  75.89 
 
 		 448 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 467 aa  941    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  62.72 
 
 		 488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  62.45 
 
 		 490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  61.6 
 
 		 491 aa  557  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  61.67 
 
 		 480 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  62.11 
 
 		 489 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  61.89 
 
 		 489 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  58.75 
 
 		 476 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  60.89 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  63.78 
 
 		 460 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  61.23 
 
 		 489 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  61.23 
 
 		 489 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  59.01 
 
 		 476 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  61.23 
 
 		 489 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  59.01 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  61.01 
 
 		 489 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  59.32 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  61.73 
 
 		 490 aa  521  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  58 
 
 		 492 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  59.61 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  59.96 
 
 		 476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  57.11 
 
 		 477 aa  512  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  59.55 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  58.9 
 
 		 432 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  58.68 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  56.93 
 
 		 475 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  54.64 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  62.99 
 
 		 465 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  51.65 
 
 		 483 aa  448  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  49.02 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  48.66 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  45.14 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  44.49 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  45.09 
 
 		 452 aa  359  6e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  44.94 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  31.11 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  31.49 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  31.05 
 
 		 401 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  30.21 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  30.53 
 
 		 415 aa  173  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  30.43 
 
 		 429 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  31.62 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  31.62 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  29.48 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  30.51 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  31.62 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  29.85 
 
 		 456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  31.37 
 
 		 415 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  30.5 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  30.71 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  30.71 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  30.71 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  30.71 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  31.28 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  29.88 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  30.83 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  29.52 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  31.46 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  28.57 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  30.98 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  28.31 
 
 		 431 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  28.54 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  30.52 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  31.09 
 
 		 427 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  28.92 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  30.05 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.99 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  24.78 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  24.59 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  26.06 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  26.17 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  26.34 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  26.34 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  27.13 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  26.59 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  25.75 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.2 
 
 		 421 aa  67  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  24.89 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.57 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.92 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  25.15 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  25.17 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  24.85 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  25.39 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.39 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  25.39 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  24.94 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  25.08 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  25.54 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  25.54 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  24.94 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  25.08 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  24.77 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  24.77 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  24.77 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  24.77 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  26.35 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  24.94 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>