More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0058 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  100 
 
 		 261 aa  533  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  53.78 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  53.78 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  53.78 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  51.92 
 
 		 258 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  52.34 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  53.01 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  53.01 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  53.2 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  53.85 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  52.42 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  52.03 
 
 		 251 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  52.03 
 
 		 251 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  52.03 
 
 		 251 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  52.03 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  52.03 
 
 		 268 aa  261  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  50.81 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  50.81 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  48.76 
 
 		 304 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  48.37 
 
 		 303 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 		 262 aa  251  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  55.41 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  47.97 
 
 		 293 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  52.77 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  51.54 
 
 		 262 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  45.83 
 
 		 301 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 		 298 aa  245  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  51.93 
 
 		 262 aa  245  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  50 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  52.8 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  52.4 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  50.42 
 
 		 265 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  50.95 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  52 
 
 		 257 aa  238  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  49.62 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  50.95 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  51.6 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  51.6 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  51.6 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  52 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  48.75 
 
 		 316 aa  234  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  46.37 
 
 		 258 aa  231  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  50.65 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  48.05 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  47.62 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  47.62 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  47.62 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  46.75 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  45.8 
 
 		 243 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  44.4 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  44.4 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  46.75 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  48.39 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  45.19 
 
 		 259 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  44.68 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  41.67 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  43.3 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  34.15 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  34.15 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  34.14 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  32.13 
 
 		 217 aa  159  6e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.67 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.6 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  34.36 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  33.47 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  35.14 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  35.14 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  38.05 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  36.49 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  36.24 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  37.9 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  35.78 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  34.48 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  34.1 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  36.44 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  35.42 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  31.98 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  36.24 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  36.21 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  32.53 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  36.04 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  34.7 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  32.5 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  37.34 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  36.52 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  33.33 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 250 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>