21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0054 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 		 537 aa  1110    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.81 
 
 		 734 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  47.6 
 
 		 850 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.75 
 
 		 648 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.92 
 
 		 962 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.32 
 
 		 722 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  43.13 
 
 		 918 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  45 
 
 		 732 aa  435  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  42.67 
 
 		 627 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.71 
 
 		 652 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  42.43 
 
 		 2117 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  41.95 
 
 		 640 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  39.67 
 
 		 640 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  40.97 
 
 		 622 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  40.89 
 
 		 844 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  41.75 
 
 		 562 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.02 
 
 		 755 aa  363  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  40 
 
 		 645 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.77 
 
 		 940 aa  356  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  39.02 
 
 		 726 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  38.24 
 
 		 722 aa  316  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>