91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0034 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1524    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  48.98 
 
 		 873 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  42.4 
 
 		 818 aa  175  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  33.89 
 
 		 966 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3334  hypothetical protein  30.13 
 
 		 483 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.920069  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  50.35 
 
 		 912 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  49.29 
 
 		 748 aa  137  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  47.29 
 
 		 674 aa  117  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.87 
 
 		 1246 aa  111  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  40.4 
 
 		 552 aa  103  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3223  hypothetical protein  28.41 
 
 		 462 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  0.039169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  26.91 
 
 		 581 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.6 
 
 		 524 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3275  leucyl-tRNA synthetase class Ia  30.86 
 
 		 892 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0104078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0255  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  31.34 
 
 		 740 aa  91.3  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.651298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  34.68 
 
 		 159 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  34.68 
 
 		 159 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3659  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  28.21 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.61 
 
 		 159 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.61 
 
 		 159 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2066  alginate lyase precursor  39.44 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.43 
 
 		 962 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3640  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  25.24 
 
 		 756 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0350459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.89 
 
 		 674 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.91 
 
 		 1564 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3103  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  26.98 
 
 		 763 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3285  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 760 aa  74.7  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000203475  normal  0.48487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 		 752 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.56 
 
 		 1362 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  28.35 
 
 		 850 aa  71.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.98 
 
 		 1158 aa  71.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  26.14 
 
 		 1471 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.74 
 
 		 1441 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 578 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  25.38 
 
 		 987 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  33.33 
 
 		 1070 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  26.32 
 
 		 557 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3274  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  26 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000152835  hitchhiker  0.00641941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11518  putative alginate lyase precursor  38.82 
 
 		 771 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 		 756 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.06 
 
 		 1117 aa  58.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.53 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  27.53 
 
 		 4013 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  35.57 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.97 
 
 		 1448 aa  57.4  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.3 
 
 		 986 aa  57  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0789  hypothetical protein  24.88 
 
 		 506 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  25.52 
 
 		 1368 aa  56.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  27.36 
 
 		 1554 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.35 
 
 		 578 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.59 
 
 		 915 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.75 
 
 		 953 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.4 
 
 		 581 aa  55.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  25.63 
 
 		 1581 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.55 
 
 		 929 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.39 
 
 		 933 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.35 
 
 		 1109 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.02 
 
 		 815 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.68 
 
 		 712 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.43 
 
 		 477 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.87 
 
 		 695 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  26.09 
 
 		 732 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  23.63 
 
 		 588 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.96 
 
 		 1321 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.52 
 
 		 971 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  24.35 
 
 		 944 aa  50.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.86 
 
 		 984 aa  50.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  33.06 
 
 		 449 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.36 
 
 		 640 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.08 
 
 		 755 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  31.82 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  34.04 
 
 		 927 aa  50.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  28.76 
 
 		 1061 aa  50.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  33.33 
 
 		 1059 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.63 
 
 		 722 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  31.15 
 
 		 1103 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.09 
 
 		 929 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.06 
 
 		 639 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.83 
 
 		 478 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1200 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  32.8 
 
 		 801 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  29.01 
 
 		 571 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  29.01 
 
 		 433 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  30 
 
 		 2095 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.48 
 
 		 1007 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  31.34 
 
 		 2095 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  35.34 
 
 		 475 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.31 
 
 		 795 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.9 
 
 		 1338 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  28.48 
 
 		 899 aa  45.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>