80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4499 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  99.63 
 
 
270 aa  553  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  99.26 
 
 
270 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  82.9 
 
 
270 aa  474  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  82.59 
 
 
270 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  82.9 
 
 
270 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  81.78 
 
 
270 aa  461  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  79.61 
 
 
255 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  55.26 
 
 
275 aa  322  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  55.64 
 
 
275 aa  322  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  55.43 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  52.63 
 
 
290 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  52.26 
 
 
272 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  52.34 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  46.76 
 
 
286 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  45.29 
 
 
293 aa  208  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  40.74 
 
 
267 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  41 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  44.26 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  43.35 
 
 
237 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  43.78 
 
 
288 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  41.35 
 
 
245 aa  195  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  38.4 
 
 
294 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  43.6 
 
 
310 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  40.85 
 
 
250 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  40.89 
 
 
330 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  38.89 
 
 
304 aa  155  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  40.37 
 
 
293 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.49 
 
 
239 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  36.07 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  35.62 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  35.62 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  35.62 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  35.62 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  35.62 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  35.62 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.62 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  35.16 
 
 
274 aa  129  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  37.75 
 
 
342 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  34.25 
 
 
307 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  34.25 
 
 
307 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  34.25 
 
 
307 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  34.25 
 
 
307 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  34.25 
 
 
307 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  35 
 
 
278 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.25 
 
 
320 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  37.25 
 
 
354 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  37.93 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  36.49 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  36.62 
 
 
243 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  36.15 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  36.15 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  36.71 
 
 
353 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  34.45 
 
 
301 aa  112  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  34.76 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  32.23 
 
 
235 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  31.06 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  35.29 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  30.09 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0422  BAX protein  34.44 
 
 
174 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  33.06 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02068  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  46.48 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0379414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02069  uncharacterized FlgJ-related protein  31.07 
 
 
150 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0320569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2235  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.56 
 
 
202 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2190  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.09 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1250  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.09 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.379236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1294  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.09 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  hitchhiker  0.00280801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1279  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.09 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.814453  hitchhiker  0.00560108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.09 
 
 
316 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00375392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>