86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4462 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009036  Sbal_4462  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 349 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  42.12 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  40.69 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  37.19 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  48.59 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  37.8 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  33.6 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.71 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  30.84 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1914  restriction modification system DNA specificity domain  27.17 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.48 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.37 
 
 		 413 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  24.32 
 
 		 427 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  27.55 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.52 
 
 		 406 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  22.92 
 
 		 427 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.73 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  30.34 
 
 		 380 aa  90.5  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  31.43 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0870  restriction modification system DNA specificity subunit  30.49 
 
 		 195 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  26.09 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  22.54 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  25.71 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2740  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  33.12 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0987272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  22.77 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  28.67 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  22.89 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  23.53 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  25.1 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  22.8 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  21.67 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  21.95 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  21.95 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.7 
 
 		 439 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  23.21 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  23.21 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  23.24 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  24.54 
 
 		 775 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.53 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  28.19 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  28.19 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.32 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  28.85 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  26.84 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  26.06 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  23.28 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  26.32 
 
 		 435 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  21.01 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  22.9 
 
 		 419 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  26.01 
 
 		 403 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  26.01 
 
 		 403 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0839  type I restriction-modification system, M subunit, putative  32.46 
 
 		 613 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  19.83 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  22.73 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  21.66 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  22.37 
 
 		 464 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  21.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  21.74 
 
 		 477 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  19.54 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  22.7 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  19.87 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.85 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0368  type I restriction-modification system, S subunit, putative  22.4 
 
 		 562 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  21.19 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.34 
 
 		 565 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  19.89 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  20.94 
 
 		 425 aa  47  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2785  type I restriction enzyme EcoR124II specificity protein  33.33 
 
 		 121 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.302167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  25.81 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  20.63 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0873  restriction modification system DNA specificity subunit  24.31 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  22.44 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  21.23 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  19.53 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  23.28 
 
 		 465 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.32 
 
 		 433 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  23.92 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.7 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  28.07 
 
 		 621 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  21.14 
 
 		 485 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  21.79 
 
 		 556 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  21.68 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  18.95 
 
 		 438 aa  42.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  19.39 
 
 		 401 aa  42.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>