More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4419 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  86.98 
 
 		 194 aa  338  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  78.57 
 
 		 196 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  78.57 
 
 		 196 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  78.57 
 
 		 196 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  78.57 
 
 		 196 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  78.06 
 
 		 196 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  78.06 
 
 		 196 aa  318  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  78.06 
 
 		 196 aa  318  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  78.06 
 
 		 196 aa  318  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  78.06 
 
 		 196 aa  317  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  69.15 
 
 		 191 aa  267  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  66.84 
 
 		 193 aa  262  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  66.49 
 
 		 192 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  65.43 
 
 		 191 aa  257  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  63.3 
 
 		 193 aa  253  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  64.36 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  64.36 
 
 		 222 aa  251  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  64.36 
 
 		 192 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 192 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  61.17 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  60.64 
 
 		 198 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  60.11 
 
 		 197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  60.11 
 
 		 197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  49.19 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  47.51 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  53.29 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  46.41 
 
 		 212 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  47.83 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 190 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  43.78 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  41.18 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  39.57 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  37.89 
 
 		 318 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  40.46 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  40.86 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.5 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.56 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  36.07 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.56 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.56 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  36.51 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  36.76 
 
 		 186 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.85 
 
 		 198 aa  110  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  35.14 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  37.91 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.13 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.13 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  36.41 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  33.16 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.3 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  34.97 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  37.36 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.23 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.23 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.23 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  33.92 
 
 		 188 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  35.68 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.18 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  34.12 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.16 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  40.27 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  38.6 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  35.71 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.94 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  35.68 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  33.69 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  33.69 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  33.88 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.84 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  34.41 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  35.33 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  35.33 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  38.33 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  36.41 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  33.88 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  35.52 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.7 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  37.42 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>