114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4348 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 
363 aa  746  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  34.91 
 
 
414 aa  166  6e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  37.22 
 
 
405 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  27.45 
 
 
430 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.06 
 
 
378 aa  119  8e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  40.88 
 
 
373 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  29.65 
 
 
446 aa  115  1e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.78 
 
 
442 aa  115  1e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  28.77 
 
 
371 aa  114  2e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  37.11 
 
 
351 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  27.35 
 
 
444 aa  109  7e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  42.96 
 
 
417 aa  109  8e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  43.31 
 
 
392 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.58 
 
 
620 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  25.76 
 
 
425 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  37.4 
 
 
438 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  26.36 
 
 
413 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  32.56 
 
 
290 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  30.08 
 
 
285 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.95 
 
 
422 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  29.03 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  26.41 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.4 
 
 
493 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  34.33 
 
 
416 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  27.75 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.82 
 
 
413 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  36.14 
 
 
415 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  35.71 
 
 
360 aa  85.9  1e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  32.91 
 
 
433 aa  85.9  1e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  30.96 
 
 
411 aa  85.1  2e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  30.96 
 
 
411 aa  85.1  2e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  29.79 
 
 
363 aa  84.3  3e-15  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  32.09 
 
 
418 aa  84  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  32.09 
 
 
418 aa  84  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  28.92 
 
 
397 aa  83.6  5e-15  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.79 
 
 
423 aa  83.6  5e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.33 
 
 
386 aa  83.2  6e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  30.6 
 
 
419 aa  82.4  1e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3768  restriction modification system DNA specificity subunit  30.67 
 
 
374 aa  82  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36553  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  29.8 
 
 
415 aa  79  1e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.5 
 
 
388 aa  77.8  3e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  36.84 
 
 
390 aa  77  4e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  22.61 
 
 
432 aa  76.6  5e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  27.59 
 
 
364 aa  76.6  6e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  26.69 
 
 
424 aa  75.9  1e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  28.85 
 
 
429 aa  73.9  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  23.98 
 
 
393 aa  73.6  5e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1094  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.7 
 
 
205 aa  73.6  5e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0782363  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3152  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  39.13 
 
 
141 aa  73.6  5e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.218767  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  31.44 
 
 
394 aa  72.8  9e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  27.08 
 
 
386 aa  72.4  1e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  38.74 
 
 
511 aa  72.4  1e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  24.12 
 
 
427 aa  72  2e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  31.75 
 
 
382 aa  71.6  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3985  restriction modification system DNA specificity subunit  30.5 
 
 
401 aa  69.7  8e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2924  restriction endonuclease S subunit  32.33 
 
 
394 aa  69.7  8e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  23.53 
 
 
419 aa  68.6  1e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  4.06123e-05 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3173  restriction modification system, type I  32.73 
 
 
394 aa  68.2  2e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  unclonable  2.52983e-14 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  29.44 
 
 
411 aa  67.8  3e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1281  restriction modification system DNA specificity subunit  37.14 
 
 
398 aa  65.5  1e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.53 
 
 
417 aa  64.7  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.83293e-08 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  29.49 
 
 
390 aa  65.1  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  26 
 
 
412 aa  64.7  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.97 
 
 
428 aa  63.2  7e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  29.41 
 
 
385 aa  61.2  3e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  33.7 
 
 
454 aa  60.8  4e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.52 
 
 
429 aa  59.7  8e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  22.37 
 
 
549 aa  58.9  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  29.75 
 
 
457 aa  58.5  2e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  22.95 
 
 
430 aa  58.5  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.11 
 
 
423 aa  58.2  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  22.14 
 
 
453 aa  57.4  3e-07  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  25.49 
 
 
422 aa  57.4  4e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  25.17 
 
 
388 aa  56.2  8e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  25 
 
 
412 aa  56.2  9e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  35.87 
 
 
571 aa  55.8  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12768  type I restriction/modification system specificity determinant hsdS.1  35 
 
 
91 aa  55.8  1e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 
429 aa  55.1  2e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3607  restriction modification system, type I  27.97 
 
 
396 aa  53.9  4e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  30.71 
 
 
418 aa  53.5  6e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2743  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  22.08 
 
 
175 aa  53.1  7e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.441032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  31.3 
 
 
447 aa  52  2e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  26.67 
 
 
417 aa  51.6  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  26.21 
 
 
439 aa  51.2  2e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  24.44 
 
 
477 aa  52  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  22.8 
 
 
398 aa  51.2  3e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  27.81 
 
 
395 aa  51.2  3e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  27.54 
 
 
385 aa  50.4  5e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.16 
 
 
401 aa  49.7  8e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  31.48 
 
 
405 aa  49.7  8e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  31.31 
 
 
419 aa  49.3  9e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  22.81 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  27.1 
 
 
584 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  24.9 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  24.54 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  22.99 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  23.3 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  22.79 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  26.23 
 
 
417 aa  46.6  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  22.81 
 
 
446 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>