More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4347 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.48 
 
 
698 aa  987    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  64.9 
 
 
698 aa  953    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
699 aa  1444    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.91 
 
 
698 aa  982    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.33 
 
 
708 aa  763    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.61 
 
 
756 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.44 
 
 
697 aa  782    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.89 
 
 
695 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.95 
 
 
691 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.5 
 
 
693 aa  730    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.82 
 
 
697 aa  763    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.07 
 
 
691 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.48 
 
 
693 aa  627  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.71 
 
 
698 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.98 
 
 
718 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.63 
 
 
724 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.65 
 
 
689 aa  512  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.7 
 
 
723 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 
712 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.75 
 
 
706 aa  501  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.32 
 
 
691 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.62 
 
 
691 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.62 
 
 
691 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41 
 
 
734 aa  486  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.27 
 
 
691 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.99 
 
 
704 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.64 
 
 
979 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40 
 
 
745 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.64 
 
 
729 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.22 
 
 
749 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.39 
 
 
733 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.62 
 
 
788 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  41.51 
 
 
691 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.74 
 
 
754 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.92 
 
 
713 aa  462  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.39 
 
 
766 aa  459  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.14 
 
 
714 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.2 
 
 
708 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.55 
 
 
762 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.42 
 
 
712 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.47 
 
 
756 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.68 
 
 
706 aa  442  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.08 
 
 
679 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.37 
 
 
741 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.73 
 
 
706 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.9 
 
 
448 aa  260  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.76 
 
 
624 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.91 
 
 
588 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.83 
 
 
568 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.82 
 
 
563 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.88 
 
 
602 aa  205  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.28 
 
 
1376 aa  203  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.9 
 
 
543 aa  204  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.76 
 
 
562 aa  204  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.24 
 
 
543 aa  203  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.24 
 
 
543 aa  203  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.46 
 
 
725 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.73 
 
 
731 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.16 
 
 
709 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.78 
 
 
634 aa  198  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.21 
 
 
602 aa  198  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.57 
 
 
593 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.57 
 
 
593 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.26 
 
 
552 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.03 
 
 
606 aa  197  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.01 
 
 
709 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.15 
 
 
646 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.01 
 
 
709 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.31 
 
 
736 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.5 
 
 
718 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.39 
 
 
681 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.03 
 
 
607 aa  193  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.13 
 
 
737 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  34.45 
 
 
679 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.23 
 
 
595 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  34.44 
 
 
669 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.07 
 
 
626 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.92 
 
 
595 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.52 
 
 
535 aa  190  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 
729 aa  190  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.49 
 
 
592 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.71 
 
 
626 aa  190  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.6 
 
 
646 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.09 
 
 
592 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.41 
 
 
603 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.24 
 
 
659 aa  189  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.79 
 
 
590 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.92 
 
 
527 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  33.53 
 
 
734 aa  189  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  35.6 
 
 
493 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.3 
 
 
557 aa  188  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.5 
 
 
662 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.65 
 
 
729 aa  187  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.58 
 
 
615 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.4 
 
 
545 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.55 
 
 
714 aa  187  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.4 
 
 
556 aa  187  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  28.19 
 
 
716 aa  187  7e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.89 
 
 
615 aa  187  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.1 
 
 
793 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>