More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4287 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  86.39 
 
 
406 aa  685  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  7.29069e-08 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  82.51 
 
 
406 aa  686  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  86.14 
 
 
406 aa  683  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  3.12687e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  98.52 
 
 
406 aa  803  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  86.39 
 
 
406 aa  684  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  8.55622e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  98.77 
 
 
406 aa  806  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  100 
 
 
406 aa  816  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.04378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  98.28 
 
 
406 aa  803  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  54.94 
 
 
407 aa  417  1e-115  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.23123e-10  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  50.49 
 
 
425 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  52.15 
 
 
405 aa  364  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  52.2 
 
 
415 aa  359  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  30.45 
 
 
415 aa  131  2e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  27.27 
 
 
415 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  25.9 
 
 
415 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  27.54 
 
 
412 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
421 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21972e-05  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  25.94 
 
 
420 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  27.74 
 
 
406 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  26.87 
 
 
421 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  27.53 
 
 
398 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  23.14 
 
 
425 aa  84.3  4e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  24.01 
 
 
391 aa  78.2  3e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  24.03 
 
 
388 aa  77.4  4e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  27.32 
 
 
431 aa  76.6  7e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.54879e-05  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  27.32 
 
 
431 aa  76.6  7e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  27.06 
 
 
431 aa  75.5  2e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  26.46 
 
 
409 aa  72.4  1e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 
390 aa  72.4  1e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
432 aa  68.2  2e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
419 aa  68.6  2e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  23.56 
 
 
432 aa  68.2  2e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  27.21 
 
 
429 aa  67.8  3e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  27.44 
 
 
408 aa  67.8  3e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
395 aa  68.2  3e-10  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.75 
 
 
388 aa  67.8  4e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  27.44 
 
 
408 aa  67.8  4e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.42276e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.75 
 
 
388 aa  67.8  4e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  25.51 
 
 
423 aa  66.6  8e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  23.12 
 
 
447 aa  66.2  9e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
408 aa  65.9  1e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  23.3 
 
 
432 aa  65.1  2e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  25.77 
 
 
435 aa  65.1  2e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  23.58 
 
 
428 aa  65.5  2e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  26.22 
 
 
428 aa  64.7  3e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.54 
 
 
505 aa  64.7  3e-09  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.35 
 
 
431 aa  64.3  4e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  24.32 
 
 
424 aa  64.3  4e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  25.5 
 
 
421 aa  63.5  6e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
434 aa  63.2  7e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  24.23 
 
 
398 aa  63.2  9e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  24.68 
 
 
409 aa  62.8  1e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25 
 
 
426 aa  62.8  1e-08  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  26.98 
 
 
417 aa  62.8  1e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  25.3 
 
 
420 aa  62  2e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 
423 aa  61.6  3e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  22.78 
 
 
426 aa  61.2  3e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  24.75 
 
 
423 aa  61.2  3e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  25 
 
 
423 aa  61.2  3e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 
423 aa  61.6  3e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  23.7 
 
 
423 aa  61.6  3e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  23.06 
 
 
421 aa  61.2  3e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  23.88 
 
 
431 aa  61.2  3e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 
423 aa  61.6  3e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 
423 aa  61.6  3e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  26.1 
 
 
428 aa  61.2  3e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  25.97 
 
 
423 aa  60.8  4e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 
415 aa  60.8  4e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 
480 aa  60.8  4e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  26.77 
 
 
420 aa  60.8  4e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  25.97 
 
 
423 aa  60.8  4e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  22.43 
 
 
410 aa  60.5  5e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  24.43 
 
 
417 aa  60.1  6e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  25.74 
 
 
415 aa  60.1  7e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  23.9 
 
 
390 aa  59.7  9e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  25.74 
 
 
415 aa  59.7  9e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.83 
 
 
478 aa  58.9  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
420 aa  59.7  1e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  21.37 
 
 
452 aa  59.3  1e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 
469 aa  59.3  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  25.66 
 
 
427 aa  59.7  1e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 
479 aa  59.3  1e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 
478 aa  59.3  1e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  21.87 
 
 
399 aa  59.3  1e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  24.49 
 
 
407 aa  58.9  1e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  25.32 
 
 
414 aa  59.7  1e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  26.83 
 
 
478 aa  59.3  1e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.26976e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 
479 aa  58.9  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 
390 aa  58.5  2e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 
478 aa  58.9  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 
478 aa  58.9  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.35395e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 
452 aa  58.9  2e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  22.59 
 
 
426 aa  58.5  2e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  22.52 
 
 
433 aa  58.5  2e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
426 aa  58.9  2e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  24.74 
 
 
426 aa  58.9  2e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  21.75 
 
 
395 aa  58.9  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  23.65 
 
 
428 aa  58.9  2e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  24.39 
 
 
421 aa  58.5  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>