More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4287 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  98.52 
 
 		 406 aa  803    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  816    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  98.77 
 
 		 406 aa  806    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  98.28 
 
 		 406 aa  803    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  86.39 
 
 		 406 aa  685    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  86.14 
 
 		 406 aa  683    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  82.51 
 
 		 406 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  86.39 
 
 		 406 aa  684    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  54.94 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  50.49 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  52.15 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 415 aa  359  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  25.9 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  25.94 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  24.01 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  24.03 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  27.32 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  27.32 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  27.06 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  27.21 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  27.44 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.75 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.75 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  27.44 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  25.51 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  23.58 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  25.77 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  26.22 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.54 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.35 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  24.32 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  25.5 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  24.23 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  26.98 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  24.68 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  25.3 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  23.7 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  24.75 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  26.1 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  25 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  23.06 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  23.88 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  25.97 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  26.77 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  22.43 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  24.43 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  25.74 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  23.9 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  25.74 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  24.49 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  26.83 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.83 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  25.32 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  21.87 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  22.52 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  21.75 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  24.74 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>