49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4213 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  86.08 
 
 
627 aa  1137    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  97.95 
 
 
683 aa  1357    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  72.58 
 
 
627 aa  924    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  97.37 
 
 
683 aa  1352    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  72.5 
 
 
612 aa  932    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  74.66 
 
 
615 aa  930    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  98.39 
 
 
683 aa  1362    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.02 
 
 
663 aa  1169    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  72.68 
 
 
613 aa  911    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
684 aa  1406    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  71.87 
 
 
610 aa  889    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.04 
 
 
659 aa  1160    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  82.89 
 
 
658 aa  1155    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.19 
 
 
665 aa  1150    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  68.89 
 
 
619 aa  888    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.64 
 
 
631 aa  598  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.29 
 
 
609 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.49 
 
 
634 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  40.75 
 
 
634 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  36.61 
 
 
592 aa  345  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.34 
 
 
581 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.86 
 
 
581 aa  318  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.28 
 
 
581 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.27 
 
 
580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  30.27 
 
 
570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  29.26 
 
 
576 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.73 
 
 
580 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.38 
 
 
577 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  28.75 
 
 
575 aa  237  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.63 
 
 
526 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  25.66 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.91 
 
 
599 aa  106  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.74 
 
 
618 aa  104  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  21.78 
 
 
541 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.44 
 
 
615 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.45 
 
 
606 aa  87.8  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.45 
 
 
606 aa  87.8  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.29 
 
 
506 aa  80.9  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.49 
 
 
585 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.71 
 
 
557 aa  54.3  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  23.47 
 
 
840 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.15 
 
 
862 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  22.73 
 
 
906 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  23.18 
 
 
923 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.03 
 
 
375 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2126  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.92 
 
 
619 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.95 
 
 
422 aa  44.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  24.85 
 
 
309 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.19 
 
 
553 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>