259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3979 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  92.65 
 
 
558 aa  1023    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  60.07 
 
 
566 aa  687    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  65.13 
 
 
565 aa  738    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  62.35 
 
 
570 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
558 aa  1140    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  45.65 
 
 
583 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  44.53 
 
 
569 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  37.99 
 
 
582 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4417  flagellar MS-ring protein  39.43 
 
 
559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.411819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3382  flagellar MS-ring protein  36.29 
 
 
548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.275908  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0234  flagellar MS-ring protein  35.85 
 
 
546 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.151863  normal  0.235707 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0250  flagellar MS-ring protein  35.71 
 
 
548 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0711  flagellar MS-ring protein  35.85 
 
 
546 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.633063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0631  flagellar MS-ring protein  36.02 
 
 
546 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
556 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  35.2 
 
 
592 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  35.03 
 
 
592 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  34.74 
 
 
592 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4655  flagellar MS-ring protein  36 
 
 
548 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702143  normal  0.459158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  34.62 
 
 
598 aa  283  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  34.56 
 
 
594 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  34.44 
 
 
597 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  35.03 
 
 
592 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 
594 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0171  flagellar MS-ring protein  35.18 
 
 
551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  33.88 
 
 
558 aa  270  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0223  flagellar MS-ring protein  35.43 
 
 
532 aa  270  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  33.86 
 
 
595 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  34.35 
 
 
561 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  33.51 
 
 
568 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  33.1 
 
 
594 aa  264  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  32.26 
 
 
590 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.69 
 
 
587 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  32.63 
 
 
552 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  33.22 
 
 
580 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.48 
 
 
600 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.82 
 
 
587 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 
587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.68 
 
 
603 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  30.86 
 
 
611 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  31.38 
 
 
570 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  31.38 
 
 
570 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  31.38 
 
 
570 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  30.51 
 
 
552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.99 
 
 
587 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.99 
 
 
587 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.99 
 
 
587 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  33.15 
 
 
567 aa  233  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.47 
 
 
611 aa  233  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 
593 aa  233  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.47 
 
 
611 aa  233  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  28.34 
 
 
544 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.2 
 
 
587 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  27.98 
 
 
544 aa  230  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  33.55 
 
 
594 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.45 
 
 
598 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 
563 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.45 
 
 
598 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.45 
 
 
598 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  35.03 
 
 
568 aa  226  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 
677 aa  226  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 
565 aa  224  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 
598 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 
598 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 
598 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 
598 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  33.26 
 
 
571 aa  223  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.1 
 
 
584 aa  221  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  33.48 
 
 
569 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.04 
 
 
595 aa  219  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 
560 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  30.63 
 
 
552 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  30.66 
 
 
568 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  31.35 
 
 
533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  30.41 
 
 
552 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  30.41 
 
 
552 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  30.41 
 
 
552 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  29.46 
 
 
548 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  30.86 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  30.63 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 
579 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 
576 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 
579 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 
579 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.38 
 
 
567 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  30.78 
 
 
563 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.36 
 
 
579 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  29.26 
 
 
527 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  29.68 
 
 
527 aa  210  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  33.04 
 
 
576 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  29.6 
 
 
580 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1641  flagellar M-ring protein FliF  34 
 
 
572 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178622  normal  0.771793 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03162  flagellar MS-ring protein  30.44 
 
 
580 aa  207  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  31.09 
 
 
574 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  31.09 
 
 
574 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  32.92 
 
 
562 aa  206  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  29.04 
 
 
566 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  29.57 
 
 
568 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  29.8 
 
 
588 aa  204  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  30.54 
 
 
519 aa  203  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>