More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3968 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  94.18 
 
 
395 aa  734    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
395 aa  796    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  75.43 
 
 
402 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  71.14 
 
 
402 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  69.5 
 
 
398 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  53.87 
 
 
399 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  52.75 
 
 
398 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  46.75 
 
 
398 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  46.46 
 
 
395 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  43.78 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  44.03 
 
 
400 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  42.54 
 
 
402 aa  326  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  41.78 
 
 
438 aa  315  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  41.4 
 
 
413 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  38.31 
 
 
462 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  42.68 
 
 
395 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  40.54 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  40.82 
 
 
440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  40.54 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  42.18 
 
 
395 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  40.93 
 
 
405 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  40.29 
 
 
407 aa  279  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  37.88 
 
 
462 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4674  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.9 
 
 
389 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  40.54 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  40.25 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  38.69 
 
 
440 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  38.27 
 
 
441 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  40.79 
 
 
404 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  39.66 
 
 
408 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  39.47 
 
 
408 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  40.33 
 
 
418 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
442 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  40.89 
 
 
407 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
443 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  38.33 
 
 
451 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  38.35 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  37.91 
 
 
425 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  34.77 
 
 
437 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  36.77 
 
 
442 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  36.32 
 
 
420 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.26 
 
 
418 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  39.85 
 
 
401 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  35.98 
 
 
453 aa  245  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  36.26 
 
 
453 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  36.26 
 
 
453 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  36.26 
 
 
453 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  37.94 
 
 
425 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  39.08 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  34.77 
 
 
437 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  38.37 
 
 
399 aa  242  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  38.61 
 
 
402 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  38.61 
 
 
402 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  38.97 
 
 
405 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  35.54 
 
 
453 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  38.86 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  35.54 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.06 
 
 
426 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  38.02 
 
 
403 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  38.02 
 
 
403 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  35.32 
 
 
453 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  38.02 
 
 
403 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  37.87 
 
 
402 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  38.37 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  38.37 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  37.24 
 
 
428 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  37.24 
 
 
428 aa  236  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  37.24 
 
 
428 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  35.16 
 
 
453 aa  235  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.15 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  37.62 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  38.52 
 
 
405 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  34.78 
 
 
460 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.49 
 
 
430 aa  233  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  35.09 
 
 
454 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  36.27 
 
 
401 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  37.53 
 
 
403 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  37.53 
 
 
403 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  36.04 
 
 
455 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  37.5 
 
 
404 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  37.87 
 
 
404 aa  229  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  35.99 
 
 
413 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  33.99 
 
 
453 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  36.23 
 
 
414 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  36.23 
 
 
414 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  36.23 
 
 
414 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  34.42 
 
 
459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  34 
 
 
453 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  35.27 
 
 
413 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  34.81 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  35.27 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  35.27 
 
 
413 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>