More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3715 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  70.48 
 
 		 535 aa  795    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  71.03 
 
 		 535 aa  800    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  76.38 
 
 		 534 aa  855    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  74.4 
 
 		 537 aa  844    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  63.51 
 
 		 584 aa  763    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  74.4 
 
 		 537 aa  844    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  72.08 
 
 		 540 aa  805    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 		 547 aa  1127    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  72.74 
 
 		 544 aa  807    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  71.45 
 
 		 537 aa  806    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  70.35 
 
 		 547 aa  790    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  76.43 
 
 		 537 aa  865    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  43.24 
 
 		 528 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  44.24 
 
 		 518 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  42.04 
 
 		 525 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  42.31 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  42.31 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  42.12 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  42.12 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  41.26 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  41.27 
 
 		 554 aa  389  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.81 
 
 		 534 aa  349  8e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  36.12 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  42.35 
 
 		 462 aa  332  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  38.83 
 
 		 495 aa  331  3e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  35.98 
 
 		 862 aa  329  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  36.56 
 
 		 863 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  36.17 
 
 		 863 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  36.36 
 
 		 853 aa  321  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  35.97 
 
 		 910 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  37.01 
 
 		 501 aa  319  7e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  36.59 
 
 		 874 aa  319  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  35.77 
 
 		 863 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  37.18 
 
 		 520 aa  317  5e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  37.24 
 
 		 524 aa  309  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  37.26 
 
 		 522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  37.24 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.65 
 
 		 855 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  37.25 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  37.24 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  37.72 
 
 		 521 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  35.8 
 
 		 856 aa  300  4e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  34.87 
 
 		 506 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2182  type I restriction-modification system, M subunit  36.35 
 
 		 527 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  36.75 
 
 		 519 aa  296  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  37.71 
 
 		 517 aa  291  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  35.32 
 
 		 505 aa  291  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  35.16 
 
 		 526 aa  289  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  34.13 
 
 		 633 aa  286  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  34.36 
 
 		 523 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  35.08 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  34.4 
 
 		 523 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  34.67 
 
 		 515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  36.63 
 
 		 574 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  34.07 
 
 		 523 aa  280  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  32.92 
 
 		 527 aa  279  8e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  35.38 
 
 		 515 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  34.77 
 
 		 523 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  33.51 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  35.5 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  36.44 
 
 		 574 aa  276  9e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  35.24 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  33.45 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  33.88 
 
 		 505 aa  273  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  33.84 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  36.77 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.52 
 
 		 587 aa  270  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  36.2 
 
 		 799 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  34.27 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  35.83 
 
 		 808 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  35.4 
 
 		 814 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  32.55 
 
 		 495 aa  262  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  36.96 
 
 		 810 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  35.36 
 
 		 809 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.09 
 
 		 860 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  34.77 
 
 		 815 aa  249  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  32.47 
 
 		 504 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  33.6 
 
 		 873 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  44.26 
 
 		 810 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  34.64 
 
 		 847 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  36.14 
 
 		 799 aa  243  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  35.14 
 
 		 824 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  32.64 
 
 		 585 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  32.84 
 
 		 505 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  34.91 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  35.91 
 
 		 814 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  34.99 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  32.64 
 
 		 822 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  34.44 
 
 		 498 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  33.46 
 
 		 496 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  34.58 
 
 		 827 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  32.94 
 
 		 808 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  34.06 
 
 		 908 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  33.2 
 
 		 816 aa  230  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  32.63 
 
 		 516 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  34.98 
 
 		 891 aa  229  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  30.9 
 
 		 568 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  31.35 
 
 		 523 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  42.81 
 
 		 871 aa  220  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  42.18 
 
 		 814 aa  220  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>