More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3673 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  100 
 
 
454 aa  915    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  81.06 
 
 
454 aa  752    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  90.09 
 
 
454 aa  827    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  79.3 
 
 
454 aa  742    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  99.56 
 
 
454 aa  911    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  77.8 
 
 
455 aa  724    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  99.56 
 
 
454 aa  911    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  89.65 
 
 
454 aa  821    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  89.65 
 
 
454 aa  823    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  89.43 
 
 
454 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  99.34 
 
 
454 aa  910    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  82.14 
 
 
454 aa  753    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  89.87 
 
 
454 aa  825    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  76.87 
 
 
454 aa  707    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  78.85 
 
 
454 aa  739    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  60.67 
 
 
453 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  56.07 
 
 
452 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  60.09 
 
 
453 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  60.31 
 
 
451 aa  531  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  60.31 
 
 
452 aa  531  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  58.56 
 
 
452 aa  534  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  60.14 
 
 
451 aa  525  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  58.39 
 
 
452 aa  521  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  51.69 
 
 
450 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  50.67 
 
 
453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  49.56 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  52.62 
 
 
452 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  51.49 
 
 
455 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  50.59 
 
 
422 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  48.44 
 
 
453 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  45.56 
 
 
453 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  44.77 
 
 
453 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  41.65 
 
 
479 aa  335  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  43.63 
 
 
494 aa  333  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  41.59 
 
 
480 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  38.36 
 
 
480 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  38.14 
 
 
480 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  40.35 
 
 
480 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  39.04 
 
 
480 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  43.67 
 
 
451 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  40.78 
 
 
480 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  40.05 
 
 
475 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  39.65 
 
 
482 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  39.65 
 
 
482 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  39.47 
 
 
480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  39.47 
 
 
480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  38.43 
 
 
481 aa  319  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  39.25 
 
 
480 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  37.56 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  37.56 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  37.56 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  36.9 
 
 
492 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  39.02 
 
 
481 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  40.64 
 
 
480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  38.77 
 
 
476 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  37.65 
 
 
477 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  37.11 
 
 
478 aa  295  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  36.22 
 
 
467 aa  291  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  36.22 
 
 
467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  35.59 
 
 
443 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  38.53 
 
 
463 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  36.43 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  36.97 
 
 
446 aa  286  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  39.06 
 
 
478 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  36.21 
 
 
492 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  35.53 
 
 
492 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  36.38 
 
 
481 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  37.13 
 
 
458 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  35.62 
 
 
456 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  35.62 
 
 
456 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  35.76 
 
 
473 aa  272  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  35.62 
 
 
456 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  35.19 
 
 
456 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  37.77 
 
 
465 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  36 
 
 
471 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  34.33 
 
 
472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  36.2 
 
 
471 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  35.95 
 
 
479 aa  263  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  34.66 
 
 
459 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.93 
 
 
484 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  36.88 
 
 
461 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  35.08 
 
 
444 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  37.2 
 
 
462 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  36.74 
 
 
442 aa  260  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  37.14 
 
 
456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  37.14 
 
 
456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  37.14 
 
 
456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  34.65 
 
 
455 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  37.14 
 
 
456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  31.64 
 
 
473 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  34.92 
 
 
445 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  34.74 
 
 
454 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  35.6 
 
 
471 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  36 
 
 
471 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0571  magnesium transporter  29.65 
 
 
456 aa  251  1e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  34.78 
 
 
445 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  33.56 
 
 
485 aa  250  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_002978  WD0375  magnesium transporter  29.69 
 
 
456 aa  249  6e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  37.74 
 
 
459 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  29.14 
 
 
456 aa  249  9e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>