47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3499 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  88.51 
 
 
496 aa  840    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  77.89 
 
 
502 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  95.36 
 
 
496 aa  878    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  100 
 
 
496 aa  939    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  95.56 
 
 
496 aa  879    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  79.48 
 
 
502 aa  767    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  95.56 
 
 
496 aa  879    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  79.68 
 
 
502 aa  768    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  58.35 
 
 
500 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  53.98 
 
 
503 aa  511  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  56.43 
 
 
498 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  41.09 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  35.63 
 
 
483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  31.47 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  28.81 
 
 
498 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  27.37 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  29.7 
 
 
627 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  29.7 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  26.5 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  31.1 
 
 
517 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  28.88 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  31.16 
 
 
415 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  27.07 
 
 
552 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  25.39 
 
 
483 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  26.55 
 
 
444 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  34.81 
 
 
183 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  45.71 
 
 
139 aa  56.6  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.94 
 
 
564 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  33.52 
 
 
170 aa  54.7  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  29.44 
 
 
241 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  33.58 
 
 
144 aa  54.3  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  30.57 
 
 
314 aa  53.9  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  39.47 
 
 
139 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  42.86 
 
 
139 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  42.86 
 
 
139 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  39.47 
 
 
139 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  39.47 
 
 
139 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  30.18 
 
 
190 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  39.47 
 
 
139 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  39.47 
 
 
139 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  34.86 
 
 
139 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  27.8 
 
 
482 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  45.71 
 
 
144 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  28.22 
 
 
457 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  36.72 
 
 
142 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  33.33 
 
 
183 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1274  hypothetical protein  36.79 
 
 
163 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>