More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3444 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  97.83 
 
 
323 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  99.38 
 
 
323 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  98.76 
 
 
323 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  100 
 
 
323 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  86.65 
 
 
323 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  84.38 
 
 
323 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  83.9 
 
 
323 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  81.73 
 
 
322 aa  547  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  80.19 
 
 
324 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  58.62 
 
 
327 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  55.03 
 
 
319 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  54.35 
 
 
327 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  51.58 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.47 
 
 
321 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  49.52 
 
 
316 aa  319  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  49.38 
 
 
321 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.16 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  51.53 
 
 
326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  46.82 
 
 
314 aa  295  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.49 
 
 
318 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.53 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.53 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2011  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.89 
 
 
321 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0323841  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.76 
 
 
345 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  37.46 
 
 
417 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  36.42 
 
 
341 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0966  diguanylate cyclase  36.59 
 
 
334 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  36.66 
 
 
343 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.78 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.37 
 
 
367 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  37.66 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.12 
 
 
737 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  35.14 
 
 
345 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.44 
 
 
336 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  39.44 
 
 
336 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  36.73 
 
 
417 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  34.53 
 
 
345 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.59 
 
 
681 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  34.91 
 
 
344 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  33.43 
 
 
356 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  39.71 
 
 
595 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  50.93 
 
 
624 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  48.73 
 
 
794 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
680 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 
399 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  50 
 
 
542 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50.98 
 
 
321 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.33 
 
 
1550 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.21 
 
 
878 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.32 
 
 
506 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  45.56 
 
 
401 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  42.69 
 
 
781 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  47.74 
 
 
400 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  47.46 
 
 
694 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  48 
 
 
1125 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  48.1 
 
 
422 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2343  putative GAF sensor protein  47.44 
 
 
165 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  37.33 
 
 
669 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  47.33 
 
 
1125 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.39 
 
 
1965 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3776  hypothetical protein  33.54 
 
 
347 aa  145  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3728  diguanylate cyclase  28.26 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183496 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2220  diguanylate cyclase  27.76 
 
 
362 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  44.3 
 
 
431 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  48.57 
 
 
497 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  45.57 
 
 
780 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  46.05 
 
 
240 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  50 
 
 
514 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.5 
 
 
531 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  44.97 
 
 
441 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  34.47 
 
 
245 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  37.93 
 
 
607 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  48 
 
 
1428 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  40.74 
 
 
226 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10742  predicted protein  50.99 
 
 
153 aa  142  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  44.72 
 
 
267 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  44.72 
 
 
276 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.74 
 
 
728 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 
640 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.44 
 
 
743 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1520  GGDEF domain-containing protein  36.84 
 
 
323 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  33.93 
 
 
249 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  43.87 
 
 
732 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  41.72 
 
 
594 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  42.24 
 
 
450 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  41.42 
 
 
363 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  38.76 
 
 
249 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 
1309 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  42.86 
 
 
406 aa  135  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
437 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  39.52 
 
 
238 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.87 
 
 
1423 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  44.44 
 
 
743 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4330  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.36 
 
 
325 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.9 
 
 
1114 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  38.76 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 
1120 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  42.67 
 
 
471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6032  predicted protein  50.34 
 
 
146 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394026  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  48 
 
 
850 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>