More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3441 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.82 
 
 
541 aa  1074  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
541 aa  1077  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  97.78 
 
 
541 aa  1024  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  97.6 
 
 
541 aa  1023  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 
541 aa  452  1e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  48 
 
 
541 aa  447  1e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 
541 aa  448  1e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
541 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 
541 aa  440  1e-122  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.78 
 
 
541 aa  439  1e-122  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.54 
 
 
539 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
539 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  45.47 
 
 
541 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 
541 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 
541 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 
541 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  3.42214e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
541 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.95 
 
 
539 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  45.32 
 
 
541 aa  415  1e-115  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 
541 aa  417  1e-115  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.71 
 
 
541 aa  400  1e-110  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 
541 aa  400  1e-110  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  44.22 
 
 
541 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  45.42 
 
 
541 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  43.46 
 
 
541 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.72 
 
 
425 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  43.59 
 
 
542 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  42.7 
 
 
546 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  42.88 
 
 
541 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
540 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  42.07 
 
 
541 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 
541 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  43.07 
 
 
541 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 
542 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
540 aa  363  5e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 
546 aa  360  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  41.65 
 
 
541 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
539 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  41.96 
 
 
539 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.17 
 
 
570 aa  354  3e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.33 
 
 
542 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.18 
 
 
546 aa  349  8e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  38.86 
 
 
542 aa  338  1e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.01 
 
 
539 aa  337  4e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2997  methyl-accepting chemotaxis protein  37.96 
 
 
542 aa  332  7e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.686035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2878  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
542 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425048  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  48.13 
 
 
550 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 
551 aa  319  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0860  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 
558 aa  313  6e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 
541 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 
550 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0995  methyl-accepting chemotaxis protein  36.76 
 
 
557 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.49 
 
 
546 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217936  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.84 
 
 
541 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 
540 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 
557 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
638 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
638 aa  255  1e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.18 
 
 
640 aa  255  2e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.44 
 
 
640 aa  254  2e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 
638 aa  253  8e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
619 aa  253  8e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  42.42 
 
 
633 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
634 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  43.15 
 
 
629 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.15 
 
 
650 aa  249  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 
541 aa  249  8e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.9 
 
 
543 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 
639 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.37 
 
 
638 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 
540 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
638 aa  244  4e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
544 aa  243  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 
522 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.09 
 
 
642 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  42.45 
 
 
642 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 
541 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  31.39 
 
 
546 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  42.82 
 
 
647 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
637 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
639 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.11 
 
 
636 aa  236  5e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
639 aa  237  5e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.4 
 
 
681 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  42.99 
 
 
676 aa  234  2e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 
547 aa  233  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 
647 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 
639 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  42.17 
 
 
640 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 
632 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
639 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 
647 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 
647 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 
640 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 
674 aa  231  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 
653 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  40.24 
 
 
647 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
639 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.96 
 
 
540 aa  229  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
739 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>