More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3432 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  99.81 
 
 
537 aa  1099    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  99.63 
 
 
537 aa  1098    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  99.07 
 
 
537 aa  1092    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  97.02 
 
 
537 aa  1072    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  99.63 
 
 
537 aa  1095    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
537 aa  1100    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.26 
 
 
553 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  35.03 
 
 
536 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  35.03 
 
 
536 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.51 
 
 
540 aa  331  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  34.65 
 
 
536 aa  329  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  34.46 
 
 
536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.48 
 
 
553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  34.46 
 
 
534 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  34.26 
 
 
536 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  34.15 
 
 
534 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  33.58 
 
 
533 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  34.65 
 
 
533 aa  323  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.86 
 
 
532 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  36.74 
 
 
538 aa  312  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  33.64 
 
 
541 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.47 
 
 
536 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0318  sensor kinase citA  34.1 
 
 
565 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003319  sensor kinase CitA  34.34 
 
 
539 aa  274  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.46 
 
 
543 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.24 
 
 
545 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.84 
 
 
532 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  31.34 
 
 
529 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.18 
 
 
541 aa  263  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  30.93 
 
 
529 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  30.93 
 
 
529 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.74 
 
 
531 aa  260  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  30.93 
 
 
529 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  31.11 
 
 
529 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  31.18 
 
 
529 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.49 
 
 
529 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.83 
 
 
552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  30.83 
 
 
552 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  30.63 
 
 
552 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  30.83 
 
 
552 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  30.22 
 
 
529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.83 
 
 
552 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
529 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  30.63 
 
 
552 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  30.63 
 
 
552 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.46 
 
 
534 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.24 
 
 
534 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.44 
 
 
529 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2790  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.41 
 
 
547 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000273411  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  28.76 
 
 
533 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  30.33 
 
 
534 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0059  sensor kinase DpiB  30.43 
 
 
552 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  29.76 
 
 
534 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  29.76 
 
 
534 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  29.76 
 
 
534 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  29.76 
 
 
534 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  29.76 
 
 
534 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  29.47 
 
 
528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  29.57 
 
 
534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  28.81 
 
 
553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0060  sensor kinase DpiB  30.22 
 
 
552 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0058  sensor kinase DpiB  30.22 
 
 
552 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736152  normal  0.965676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  29.57 
 
 
534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0057  sensor kinase DpiB  30.22 
 
 
552 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0425242  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  29.01 
 
 
553 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  28.81 
 
 
553 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  28.81 
 
 
553 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0058  sensor kinase DpiB  30.02 
 
 
552 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  0.361929 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.73 
 
 
540 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.04 
 
 
555 aa  229  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  29.21 
 
 
534 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  29.59 
 
 
538 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.21 
 
 
538 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.17 
 
 
583 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  30.29 
 
 
537 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.52 
 
 
526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  29.57 
 
 
537 aa  220  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  31.47 
 
 
520 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  28.57 
 
 
533 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  29.94 
 
 
542 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  29.55 
 
 
543 aa  216  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.36 
 
 
543 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  29.55 
 
 
543 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  29.55 
 
 
543 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.41 
 
 
525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  29.36 
 
 
543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  28.98 
 
 
542 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  29.17 
 
 
543 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  28.98 
 
 
543 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  28.98 
 
 
543 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  29.17 
 
 
543 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  28.98 
 
 
543 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  28.98 
 
 
543 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.28 
 
 
558 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.28 
 
 
540 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.61 
 
 
527 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.35 
 
 
529 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.76 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.74 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.05 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>