66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2968 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  59.03 
 
 		 823 aa  992    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  59.32 
 
 		 821 aa  1006    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 		 826 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 822 aa  1681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  64.96 
 
 		 822 aa  1124    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  91.48 
 
 		 820 aa  1539    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  44.63 
 
 		 841 aa  714    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  42.03 
 
 		 833 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  41.28 
 
 		 824 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  38.34 
 
 		 825 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  38.01 
 
 		 826 aa  566  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  29.69 
 
 		 841 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 826 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 826 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  29.21 
 
 		 837 aa  364  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 839 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  28.8 
 
 		 833 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  26.09 
 
 		 812 aa  255  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  26.88 
 
 		 871 aa  192  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  27.56 
 
 		 629 aa  80.5  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  24.5 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  26.57 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  26.58 
 
 		 673 aa  71.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  23.77 
 
 		 429 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  23.65 
 
 		 618 aa  70.1  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  24.78 
 
 		 435 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  24.78 
 
 		 435 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  27.11 
 
 		 608 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  25.57 
 
 		 570 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  26.61 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  25.64 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  23.75 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  35.14 
 
 		 577 aa  57.4  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  24.66 
 
 		 431 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  26.2 
 
 		 676 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  23.98 
 
 		 605 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.42 
 
 		 616 aa  56.6  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  22.64 
 
 		 626 aa  55.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  25.79 
 
 		 662 aa  54.7  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  24.05 
 
 		 666 aa  53.5  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  23.24 
 
 		 442 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  23.24 
 
 		 442 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  23.95 
 
 		 446 aa  51.2  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  24.75 
 
 		 560 aa  50.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  24.69 
 
 		 635 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  25.9 
 
 		 578 aa  50.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  24.87 
 
 		 607 aa  49.3  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 615 aa  48.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.59 
 
 		 616 aa  47.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 313 aa  47.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  25.29 
 
 		 645 aa  47.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  24.08 
 
 		 632 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  27.81 
 
 		 440 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  23.33 
 
 		 605 aa  46.2  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  22.42 
 
 		 661 aa  45.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  22.16 
 
 		 578 aa  45.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 280 aa  45.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 297 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 297 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  19.57 
 
 		 891 aa  44.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  24.14 
 
 		 671 aa  44.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  26.23 
 
 		 605 aa  44.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1179 aa  44.3  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  20.11 
 
 		 629 aa  44.3  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>