More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2963 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  100 
 
 
303 aa  638  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  83.17 
 
 
303 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  54.33 
 
 
305 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  48.29 
 
 
310 aa  326  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  35.82 
 
 
297 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  38.11 
 
 
298 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  36.32 
 
 
382 aa  141  1e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 
267 aa  95.9  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  30.52 
 
 
285 aa  84.7  2e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.77 
 
 
345 aa  82.4  9e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  30.29 
 
 
273 aa  80.1  4e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
358 aa  79  1e-13  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  29.24 
 
 
248 aa  76.3  6e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  8.22833e-10 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.39 
 
 
672 aa  76.3  6e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.83 
 
 
275 aa  75.9  7e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  26.46 
 
 
326 aa  75.5  1e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  25.51 
 
 
305 aa  75.1  1e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  26.46 
 
 
326 aa  75.5  1e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 
300 aa  74.7  2e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  28.18 
 
 
240 aa  73.9  3e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.58625e-10 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  28.57 
 
 
312 aa  73.6  4e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
333 aa  73.2  5e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  32.87 
 
 
282 aa  73.2  5e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28 
 
 
330 aa  73.2  5e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.35 
 
 
274 aa  72.8  6e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  28.37 
 
 
402 aa  72.4  9e-12  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
323 aa  71.2  2e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
323 aa  71.2  2e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
306 aa  70.9  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
310 aa  71.6  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
335 aa  70.5  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  26.94 
 
 
304 aa  69.3  7e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.19 
 
 
277 aa  68.9  9e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2204  methyltransferase type 12  24.36 
 
 
304 aa  68.6  1e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  30 
 
 
625 aa  68.9  1e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  31.29 
 
 
332 aa  68.6  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  29.27 
 
 
1046 aa  68.2  2e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
1094 aa  67.4  3e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  26.09 
 
 
304 aa  67  4e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  23.24 
 
 
291 aa  67  4e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  29.11 
 
 
308 aa  67  4e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.7 
 
 
318 aa  66.6  5e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 
317 aa  66.6  5e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  23.65 
 
 
332 aa  66.6  5e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  31.69 
 
 
273 aa  66.2  7e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  24.41 
 
 
298 aa  65.9  9e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
214 aa  65.5  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.32 
 
 
298 aa  65.1  1e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  26.96 
 
 
307 aa  65.5  1e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
222 aa  64.7  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.14 
 
 
303 aa  64.7  2e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  1.29076e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  24.89 
 
 
574 aa  63.5  4e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  24.53 
 
 
287 aa  63.2  5e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  25.41 
 
 
353 aa  63.2  5e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
353 aa  63.2  5e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  25.86 
 
 
281 aa  63.5  5e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  26.91 
 
 
371 aa  62.8  6e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  25.14 
 
 
215 aa  62.4  8e-09  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  26.57 
 
 
407 aa  61.6  1e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  25.32 
 
 
407 aa  62  1e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  27.17 
 
 
408 aa  61.6  2e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  26.91 
 
 
607 aa  61.6  2e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  26.47 
 
 
407 aa  61.6  2e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  27.36 
 
 
310 aa  61.6  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  26.97 
 
 
409 aa  61.2  2e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  25.87 
 
 
407 aa  60.5  3e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
238 aa  60.8  3e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  27.97 
 
 
413 aa  60.5  3e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  27.97 
 
 
413 aa  60.5  4e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  22.89 
 
 
303 aa  60.1  4e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  30.37 
 
 
613 aa  60.1  4e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.99 
 
 
415 aa  60.1  4e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
383 aa  60.1  4e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  19.75 
 
 
310 aa  60.1  5e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  25.94 
 
 
314 aa  59.7  5e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 
242 aa  60.1  5e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
286 aa  59.7  6e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  26.42 
 
 
308 aa  59.7  6e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.03 
 
 
336 aa  59.3  8e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  28.65 
 
 
264 aa  58.5  1e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  30.86 
 
 
267 aa  58.9  1e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
222 aa  58.5  1e-07  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  25.56 
 
 
383 aa  58.5  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  29.52 
 
 
309 aa  58.9  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  34.19 
 
 
208 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  27.33 
 
 
431 aa  58.2  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  33.55 
 
 
207 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  27.18 
 
 
263 aa  58.2  2e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
244 aa  58.2  2e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  23.66 
 
 
236 aa  57.4  3e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  4.22466e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  34.88 
 
 
185 aa  57.4  3e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.98 
 
 
457 aa  57.4  3e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  24.89 
 
 
305 aa  57.4  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  23.35 
 
 
373 aa  57.4  3e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  32.11 
 
 
237 aa  57  4e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
248 aa  56.6  5e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
248 aa  56.6  5e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  25.73 
 
 
572 aa  56.2  6e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>