More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2962 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  76.44 
 
 
400 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  100 
 
 
401 aa  832    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  34.87 
 
 
885 aa  94  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
634 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
255 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
1106 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
810 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
209 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5458  Methyltransferase type 12  31.94 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
1032 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.27 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
240 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
282 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.26 
 
 
330 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.46 
 
 
239 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
225 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
241 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
293 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
204 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.52 
 
 
345 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  26.99 
 
 
870 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 
234 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
204 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.58 
 
 
232 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
215 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.05 
 
 
238 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 
243 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
260 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
204 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  37.9 
 
 
254 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.44 
 
 
200 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
264 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.63 
 
 
232 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  35.51 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  28 
 
 
264 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 
258 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.03 
 
 
244 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.84 
 
 
280 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  34 
 
 
275 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35 
 
 
232 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  33.87 
 
 
205 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
226 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
207 aa  60.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  28.28 
 
 
199 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
253 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  27.27 
 
 
226 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.68 
 
 
249 aa  59.7  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  28.03 
 
 
274 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  28.08 
 
 
232 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.28 
 
 
236 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
271 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 
239 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
270 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  35.24 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
328 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  34.58 
 
 
310 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  30 
 
 
221 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.82 
 
 
239 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
275 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  32.76 
 
 
273 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  33.68 
 
 
202 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  32.69 
 
 
306 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
257 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.25 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 
232 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
246 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 
232 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  26.46 
 
 
287 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  27.27 
 
 
226 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  27.27 
 
 
209 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  30 
 
 
205 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  23.88 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  27.52 
 
 
238 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.56 
 
 
232 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.66 
 
 
232 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
238 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  31.25 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2693  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
256 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
265 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  27.27 
 
 
250 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.67 
 
 
232 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>