37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2953 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  99.33 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  99.33 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  98.66 
 
 
149 aa  304  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  92.62 
 
 
149 aa  291  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  90.6 
 
 
149 aa  289  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  90.6 
 
 
149 aa  289  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  89.93 
 
 
149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  89.26 
 
 
149 aa  285  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  75.17 
 
 
148 aa  244  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  80.27 
 
 
148 aa  243  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  74.15 
 
 
148 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  77.94 
 
 
148 aa  231  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  70.47 
 
 
148 aa  231  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  70.86 
 
 
151 aa  224  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  79.39 
 
 
148 aa  220  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  52.48 
 
 
161 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  46.98 
 
 
155 aa  153  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  53.44 
 
 
155 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  42.11 
 
 
143 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  41.35 
 
 
143 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  38.97 
 
 
144 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  49.47 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  45.45 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  44.44 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  42.27 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  41.67 
 
 
223 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  35.14 
 
 
209 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  34.62 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  27.93 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  31.43 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  24.22 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  31.4 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  31.4 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  31.46 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  28.81 
 
 
292 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  37.5 
 
 
302 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>