More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2944 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  85.87 
 
 
453 aa  774    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  86.09 
 
 
453 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  85.87 
 
 
453 aa  774    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
460 aa  921    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  77.39 
 
 
453 aa  688    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  74.57 
 
 
454 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  85.87 
 
 
453 aa  774    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  75.32 
 
 
455 aa  676    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  86.09 
 
 
453 aa  758    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  85.87 
 
 
453 aa  754    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  77.8 
 
 
459 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  86.74 
 
 
453 aa  775    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  85.65 
 
 
453 aa  764    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  75.87 
 
 
453 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  77.61 
 
 
453 aa  720    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  77.61 
 
 
453 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  53.38 
 
 
461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  52.41 
 
 
458 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  47.85 
 
 
434 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  45.99 
 
 
425 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  47 
 
 
437 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2335  flagellar hook protein FlgE  48.48 
 
 
432 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  45.96 
 
 
437 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  43.32 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.14 
 
 
435 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  38.2 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  57.74 
 
 
554 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  37.01 
 
 
408 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  39.18 
 
 
407 aa  280  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  39.18 
 
 
407 aa  280  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  38.32 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.32 
 
 
423 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  37.92 
 
 
462 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  38.92 
 
 
462 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  38.36 
 
 
408 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  38.17 
 
 
405 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  39.45 
 
 
440 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  36.19 
 
 
420 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  38.83 
 
 
442 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  37.53 
 
 
407 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  38.88 
 
 
441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  38.84 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  37.53 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.1 
 
 
418 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  37.08 
 
 
443 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  36.31 
 
 
437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  36.63 
 
 
437 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  36.44 
 
 
410 aa  250  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.54 
 
 
430 aa  249  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  37.5 
 
 
425 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 
413 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  36.19 
 
 
406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  36.21 
 
 
450 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  36.99 
 
 
414 aa  246  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.67 
 
 
395 aa  246  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  36.96 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  36.96 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  36.96 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  36.96 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  36.96 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  36.96 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1669  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.51 
 
 
423 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456133  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.42 
 
 
426 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  36.74 
 
 
413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  34.06 
 
 
401 aa  243  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 
413 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  36.13 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  35.06 
 
 
402 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  36.13 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  35.06 
 
 
402 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.65 
 
 
423 aa  240  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  36.29 
 
 
413 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  35.16 
 
 
442 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  36.23 
 
 
413 aa  236  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  35.64 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  35.22 
 
 
402 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 
401 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 
414 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 
414 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 
414 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  34.19 
 
 
398 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  35.42 
 
 
404 aa  229  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  35.28 
 
 
402 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 
398 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  34.13 
 
 
398 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  34.71 
 
 
414 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  34.33 
 
 
413 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  34.69 
 
 
410 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  34.78 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  35.64 
 
 
404 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  34.2 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  33.84 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  32.68 
 
 
399 aa  207  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.18 
 
 
400 aa  206  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 
395 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  31.83 
 
 
496 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  31.75 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  34.64 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  33.62 
 
 
413 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>