254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2938 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  85.19 
 
 
386 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  98.13 
 
 
641 aa  1271    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  66.93 
 
 
640 aa  886    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  65.79 
 
 
639 aa  848    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  98.6 
 
 
641 aa  1276    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  88.61 
 
 
641 aa  1159    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  85.8 
 
 
641 aa  1129    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  85.96 
 
 
641 aa  1128    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  67.34 
 
 
642 aa  888    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  66.46 
 
 
637 aa  856    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  88.46 
 
 
641 aa  1160    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  98.13 
 
 
641 aa  1271    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  68.49 
 
 
638 aa  865    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  73.17 
 
 
638 aa  959    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  68.17 
 
 
638 aa  890    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
641 aa  1289    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  35.06 
 
 
665 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  34.32 
 
 
626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  31.87 
 
 
646 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1783  flagellar hook-associated protein FlgK  32.25 
 
 
624 aa  309  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  32.75 
 
 
682 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 
637 aa  293  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  33.63 
 
 
676 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  31.7 
 
 
681 aa  286  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  32.41 
 
 
681 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.59 
 
 
647 aa  263  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  33.74 
 
 
637 aa  259  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  31.16 
 
 
645 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  29.01 
 
 
688 aa  258  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  32.9 
 
 
686 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  30.7 
 
 
649 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  30.55 
 
 
649 aa  253  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 
680 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  30.52 
 
 
683 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
680 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  31.81 
 
 
686 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  31.96 
 
 
629 aa  239  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 
682 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 
624 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 
624 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.56 
 
 
638 aa  234  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 
631 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  30.78 
 
 
626 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 
683 aa  233  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.93 
 
 
657 aa  228  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  31.32 
 
 
642 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  31.27 
 
 
640 aa  227  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 
652 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  30.78 
 
 
645 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  30.78 
 
 
645 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  28.9 
 
 
680 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  28.7 
 
 
644 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
667 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
667 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
714 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
667 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
667 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
667 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
667 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
667 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  27.7 
 
 
709 aa  217  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  30.57 
 
 
631 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  30.14 
 
 
643 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  30.14 
 
 
643 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  30.14 
 
 
643 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  30.91 
 
 
640 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  30.62 
 
 
659 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.65 
 
 
685 aa  204  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  28.74 
 
 
642 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 
640 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  26.82 
 
 
695 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  28.68 
 
 
641 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  29.81 
 
 
660 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 
657 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  26.18 
 
 
658 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  26.55 
 
 
672 aa  186  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  28.59 
 
 
657 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 
642 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  28.23 
 
 
630 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  27.67 
 
 
920 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
665 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  25.73 
 
 
691 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  24.74 
 
 
658 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 
660 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  27.45 
 
 
653 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  29.08 
 
 
665 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  31.47 
 
 
549 aa  166  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  28.23 
 
 
546 aa  166  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.2  flagellar protein  83.16 
 
 
141 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 
554 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 
554 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 
554 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 
547 aa  153  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 
547 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 
547 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 
548 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 
547 aa  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 
547 aa  150  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 
547 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>