More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2893 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  72.67 
 
 
920 aa  1370    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  100 
 
 
912 aa  1850    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  44.18 
 
 
920 aa  746    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  81.54 
 
 
921 aa  1560    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  70.46 
 
 
931 aa  1360    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  83.9 
 
 
919 aa  1591    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  67.14 
 
 
922 aa  1286    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  63.85 
 
 
828 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  40.33 
 
 
897 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  62.32 
 
 
828 aa  636    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  63.81 
 
 
919 aa  1206    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  67.43 
 
 
910 aa  1267    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  73.06 
 
 
915 aa  1380    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  45.84 
 
 
828 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  37.51 
 
 
869 aa  609  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  38.12 
 
 
852 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  60.21 
 
 
827 aa  602  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  60.6 
 
 
837 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  60.6 
 
 
837 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  61.62 
 
 
837 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  37.17 
 
 
869 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  32.9 
 
 
833 aa  362  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  32.42 
 
 
1055 aa  249  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  31.01 
 
 
948 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  33.41 
 
 
753 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  30.09 
 
 
781 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  26.23 
 
 
947 aa  232  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  29.45 
 
 
834 aa  231  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  29.06 
 
 
869 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  28.55 
 
 
800 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  28.47 
 
 
812 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  30.87 
 
 
952 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  27.99 
 
 
833 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  34.92 
 
 
779 aa  219  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  26.74 
 
 
977 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  27.94 
 
 
936 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.96 
 
 
830 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  34.47 
 
 
849 aa  208  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  26.79 
 
 
846 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.26 
 
 
877 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  37.01 
 
 
940 aa  198  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  26.89 
 
 
824 aa  193  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.37 
 
 
877 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  36.4 
 
 
576 aa  191  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.18 
 
 
875 aa  191  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.21 
 
 
800 aa  191  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.81 
 
 
803 aa  189  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  28.03 
 
 
823 aa  181  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  26.91 
 
 
791 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  31.48 
 
 
830 aa  174  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  33.61 
 
 
568 aa  163  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  27.99 
 
 
580 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  29.01 
 
 
478 aa  120  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
425 aa  115  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  29.41 
 
 
605 aa  106  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  23.87 
 
 
473 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  29.84 
 
 
579 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.7 
 
 
552 aa  97.4  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.23 
 
 
552 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  29.15 
 
 
587 aa  96.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  30.22 
 
 
516 aa  97.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  27.72 
 
 
552 aa  95.9  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.44 
 
 
552 aa  95.1  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  29.57 
 
 
537 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  26.45 
 
 
603 aa  93.2  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  30 
 
 
508 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.67 
 
 
388 aa  90.5  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  24.09 
 
 
606 aa  89.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.16 
 
 
495 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25.16 
 
 
495 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  25.34 
 
 
609 aa  88.2  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.29 
 
 
387 aa  88.2  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  26.78 
 
 
347 aa  88.2  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  28.87 
 
 
558 aa  88.2  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  26.59 
 
 
362 aa  87.8  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  24.32 
 
 
551 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.77 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  27.98 
 
 
268 aa  84.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  22.11 
 
 
495 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.75 
 
 
703 aa  83.2  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  27.54 
 
 
379 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.85 
 
 
393 aa  83.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  27.54 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  27.54 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
565 aa  82.4  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.54 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  27.73 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  27.54 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.54 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.54 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.09 
 
 
317 aa  82  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.05 
 
 
386 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  25.41 
 
 
700 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  25.6 
 
 
373 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  27.98 
 
 
557 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  25.6 
 
 
386 aa  80.1  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  28.89 
 
 
606 aa  79.7  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.17 
 
 
700 aa  79  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  28.78 
 
 
397 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>