193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2723 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
232 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  96.98 
 
 
232 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  97.41 
 
 
232 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  71.81 
 
 
246 aa  335  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.7 
 
 
247 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.86 
 
 
239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.86 
 
 
239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.7 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 
239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 
239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.7 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.7 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 
239 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.65 
 
 
254 aa  310  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.07 
 
 
239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.07 
 
 
239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  64.57 
 
 
255 aa  305  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.76 
 
 
238 aa  304  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.07 
 
 
239 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  65.62 
 
 
239 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  64.76 
 
 
238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  63.68 
 
 
255 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  64.76 
 
 
245 aa  299  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.47 
 
 
239 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.57 
 
 
239 aa  294  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.47 
 
 
246 aa  292  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  62.67 
 
 
244 aa  291  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.54 
 
 
250 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  61.84 
 
 
239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.19 
 
 
244 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.19 
 
 
244 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.09 
 
 
340 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.09 
 
 
242 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.42 
 
 
244 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  54.19 
 
 
242 aa  258  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.99 
 
 
340 aa  257  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  55.36 
 
 
439 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  57.59 
 
 
274 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.19 
 
 
239 aa  255  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.57 
 
 
236 aa  254  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
263 aa  248  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.66 
 
 
267 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.66 
 
 
267 aa  247  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.7 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  52.23 
 
 
258 aa  242  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.43 
 
 
244 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.09 
 
 
243 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.53 
 
 
260 aa  224  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  46.49 
 
 
344 aa  221  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.85 
 
 
245 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.64 
 
 
260 aa  218  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
260 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
260 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  45.65 
 
 
269 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  45.65 
 
 
312 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  48.21 
 
 
255 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
255 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  45.65 
 
 
269 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  45.65 
 
 
269 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  45.65 
 
 
269 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  45.65 
 
 
269 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  45.22 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
260 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
260 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
260 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  46.19 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.19 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  47.98 
 
 
242 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  43.17 
 
 
259 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.36 
 
 
338 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
248 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  39.73 
 
 
234 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  40 
 
 
252 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  39.01 
 
 
238 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  39.11 
 
 
230 aa  174  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  36.41 
 
 
230 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
257 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
262 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  36.61 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.61 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  36.61 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  36.61 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  36.61 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  36.61 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  36.61 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.09 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.77 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.67 
 
 
260 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  37.67 
 
 
260 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  37.67 
 
 
260 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  37.67 
 
 
260 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
260 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
260 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
247 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  36.73 
 
 
247 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>