More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2692 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  100 
 
 
338 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  99.11 
 
 
338 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  98.82 
 
 
338 aa  679    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  99.39 
 
 
330 aa  668    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  92.6 
 
 
338 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  92.6 
 
 
338 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  92.31 
 
 
338 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  92.6 
 
 
338 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  92.01 
 
 
338 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  76.61 
 
 
343 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  78.65 
 
 
343 aa  554  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  81.23 
 
 
342 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  76.26 
 
 
337 aa  547  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  75.44 
 
 
336 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  81.29 
 
 
343 aa  527  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  74.56 
 
 
337 aa  528  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  59.2 
 
 
349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  55.97 
 
 
353 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  57.1 
 
 
353 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  58.13 
 
 
349 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  55.4 
 
 
353 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  54.18 
 
 
348 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  53.47 
 
 
348 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  54.18 
 
 
348 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  52.71 
 
 
348 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  54.6 
 
 
340 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  54.18 
 
 
348 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  55.59 
 
 
349 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  55.59 
 
 
349 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  55.75 
 
 
349 aa  362  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  55.59 
 
 
349 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  55.59 
 
 
349 aa  362  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  55.59 
 
 
349 aa  362  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  56.39 
 
 
344 aa  362  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  56.29 
 
 
348 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  56.29 
 
 
348 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  56.29 
 
 
348 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  56.29 
 
 
348 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  55.3 
 
 
349 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  55.59 
 
 
349 aa  361  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  56.34 
 
 
353 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  52.45 
 
 
348 aa  359  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  52.16 
 
 
348 aa  359  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  56 
 
 
348 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  53.89 
 
 
347 aa  352  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  52.16 
 
 
348 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  53.99 
 
 
339 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  54.38 
 
 
339 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  54.08 
 
 
339 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  53.08 
 
 
340 aa  338  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  50.3 
 
 
334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  53.5 
 
 
339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  48.04 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  51.69 
 
 
347 aa  323  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  46.73 
 
 
353 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  50.44 
 
 
340 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  51.23 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  50.76 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  50.44 
 
 
340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  46.57 
 
 
338 aa  311  6.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  46.27 
 
 
338 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  48.37 
 
 
342 aa  309  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  48.49 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  48.49 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  52.31 
 
 
339 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  48.73 
 
 
325 aa  305  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  53.36 
 
 
324 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  52.33 
 
 
326 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  43.9 
 
 
333 aa  299  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  54.68 
 
 
332 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  44.41 
 
 
356 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  49.7 
 
 
347 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  47.34 
 
 
349 aa  291  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  44.18 
 
 
332 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  48.75 
 
 
312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  48.44 
 
 
312 aa  281  9e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  44.16 
 
 
335 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  49.02 
 
 
234 aa  192  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  46.98 
 
 
216 aa  187  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  47.27 
 
 
165 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  33.87 
 
 
364 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  33.47 
 
 
364 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  32.04 
 
 
552 aa  98.2  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.98 
 
 
547 aa  97.4  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  40 
 
 
286 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  41.98 
 
 
286 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  40.46 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  34.29 
 
 
349 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.38 
 
 
625 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.03 
 
 
325 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  33.51 
 
 
609 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  34.78 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.5 
 
 
629 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  31.9 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  32.03 
 
 
316 aa  90.5  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  39.88 
 
 
293 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.85 
 
 
339 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  32.68 
 
 
278 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.46 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>