24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2495 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2495  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1856  hypothetical protein  98.84 
 
 
259 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0849639  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2608  hypothetical protein  98.84 
 
 
259 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0307419  decreased coverage  0.000510715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2488  hypothetical protein  98.84 
 
 
259 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2249  hypothetical protein  89.58 
 
 
259 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2650  hypothetical protein  86.87 
 
 
259 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1730  hypothetical protein  87.64 
 
 
259 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0608955  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1661  hypothetical protein  86.87 
 
 
259 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100464  unclonable  0.0000162352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1586  hypothetical protein  86.87 
 
 
259 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.0602505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1323  hypothetical protein  76.95 
 
 
257 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1804  hypothetical protein  75.29 
 
 
257 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389393  hitchhiker  0.0035838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1449  hypothetical protein  78.01 
 
 
259 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000835814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2097  hypothetical protein  77.12 
 
 
259 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1623  hypothetical protein  75.1 
 
 
258 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.0571919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2840  hypothetical protein  77.69 
 
 
257 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0776012  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1536  hypothetical protein  68.75 
 
 
258 aa  345  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0198685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1690  hypothetical protein  32.82 
 
 
254 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.278449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01943  hypothetical protein  35.54 
 
 
250 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1622  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1199  hypothetical protein  36.25 
 
 
256 aa  135  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01792  hypothetical protein  30.65 
 
 
254 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1499  hypothetical protein  29.27 
 
 
262 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000480676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003884  DNA repair ATPase  30.17 
 
 
232 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1768  hypothetical protein  23.76 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>