146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2470 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1881  arginyl-tRNA-protein transferase  99.58 
 
 
236 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000197497  hitchhiker  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2470  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 
236 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000771659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2463  arginyl-tRNA-protein transferase  99.58 
 
 
236 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000249099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2583  arginyl-tRNA-protein transferase  99.15 
 
 
236 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000870424  normal  0.0975132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  85.11 
 
 
238 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000858101  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1650  arginyl-tRNA-protein transferase  85.11 
 
 
238 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736484  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1725  arginyl-tRNA-protein transferase  85.11 
 
 
238 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000702749  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2624  arginyl-tRNA-protein transferase  83.4 
 
 
238 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  84.05 
 
 
235 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2054  arginyl-tRNA-protein transferase  68.12 
 
 
237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000273717  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2697  arginyl-tRNA-protein transferase  62.77 
 
 
236 aa  324  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  normal  0.128903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1888  arginyl-tRNA-protein transferase  64.07 
 
 
236 aa  324  9e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000499329  hitchhiker  0.000014618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1836  arginyl-tRNA-protein transferase  66.07 
 
 
233 aa  316  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000137975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2252  arginyl-tRNA-protein transferase  61.54 
 
 
239 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000157492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  59.57 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1568  arginyl-tRNA-protein transferase  59.4 
 
 
234 aa  299  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000198847  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  46.88 
 
 
231 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2216  arginyl-tRNA-protein transferase  43.23 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  44.7 
 
 
236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1337  arginyl-tRNA-protein transferase  43.53 
 
 
233 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01569  arginyl-tRNA-protein transferase  42.92 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2764  arginyl-tRNA-protein transferase  41.35 
 
 
253 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0812306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01638  arginyl-tRNA-protein transferase  45.23 
 
 
214 aa  185  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  43.67 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003954  arginine-tRNA-protein transferase  41.81 
 
 
233 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000149764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  43.17 
 
 
235 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  44.02 
 
 
235 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  43.59 
 
 
235 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  42.73 
 
 
235 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  43.61 
 
 
252 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 
235 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  42.67 
 
 
235 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  41.41 
 
 
235 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  42.31 
 
 
235 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  42.67 
 
 
235 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  41.4 
 
 
237 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  39.08 
 
 
281 aa  164  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  39.19 
 
 
233 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  39.91 
 
 
238 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  39.91 
 
 
240 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  41.01 
 
 
247 aa  158  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1559  arginyl-tRNA-protein transferase  41.55 
 
 
254 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0919298  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  38.14 
 
 
247 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  37.99 
 
 
254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  39.11 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  37.99 
 
 
254 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  38.12 
 
 
251 aa  151  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  37.96 
 
 
238 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  37.22 
 
 
251 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  36.24 
 
 
242 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  36.89 
 
 
276 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  36.89 
 
 
276 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  36.89 
 
 
276 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  36.89 
 
 
276 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  36.89 
 
 
276 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  36.89 
 
 
276 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  36.89 
 
 
276 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  37.07 
 
 
249 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  36.05 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  35.37 
 
 
249 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  39.5 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  35.37 
 
 
249 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  36.09 
 
 
258 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  35.68 
 
 
257 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  35.34 
 
 
249 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  34.84 
 
 
251 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  34.1 
 
 
247 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  36.56 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  35.78 
 
 
260 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  34.98 
 
 
255 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  35.37 
 
 
249 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  37.96 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  35.87 
 
 
253 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  36.24 
 
 
248 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  36.99 
 
 
241 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  38 
 
 
258 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  35.71 
 
 
266 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  34.38 
 
 
249 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3062  arginyl-tRNA-protein transferase  35.14 
 
 
283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  34.53 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  34.78 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  37.23 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  36.56 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  35.81 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  35.5 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  34.08 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  35.27 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  34.67 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  33.48 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  34.35 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>