51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2316 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 69 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  76.56 
 
 		 68 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 71 aa  90.5  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  67.19 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  55.88 
 
 		 74 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  63.49 
 
 		 68 aa  83.6  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  58.73 
 
 		 72 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  43.48 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  33.85 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 262 aa  50.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0305  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00365078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2963  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.364459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3923  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.551914  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0418  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007588  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  38.18 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  35.29 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3131  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  27.42 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 71 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  36.36 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 75 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>