91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2051 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  80.8 
 
 
375 aa  648  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  92.27 
 
 
375 aa  734  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  80.8 
 
 
375 aa  650  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  99.47 
 
 
375 aa  778  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  92.8 
 
 
375 aa  733  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  1.23678e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  79.47 
 
 
375 aa  650  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  5.68724e-06  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  92.27 
 
 
375 aa  731  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  99.47 
 
 
375 aa  777  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  7.23635e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  81.07 
 
 
375 aa  650  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.28738e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  99.2 
 
 
375 aa  775  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  92.8 
 
 
375 aa  733  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  79.47 
 
 
375 aa  646  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.69 
 
 
374 aa  672  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
375 aa  781  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  93.6 
 
 
375 aa  739  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.42 
 
 
376 aa  672  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  74.4 
 
 
375 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  71.16 
 
 
378 aa  582  1e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  70.18 
 
 
379 aa  568  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  55.88 
 
 
374 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.14112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  56.15 
 
 
400 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  56.58 
 
 
380 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  55.08 
 
 
374 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  57.07 
 
 
375 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  55.88 
 
 
376 aa  441  1e-122  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  55.47 
 
 
379 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  52.83 
 
 
384 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.21 
 
 
383 aa  421  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.27 
 
 
375 aa  399  1e-110  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.35 
 
 
381 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.81 
 
 
380 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  50.81 
 
 
381 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.07 
 
 
380 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.73 
 
 
380 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  50 
 
 
383 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.73445e-07  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.49 
 
 
379 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.34 
 
 
384 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  51.35 
 
 
381 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.61 
 
 
382 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  47.61 
 
 
375 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  48.82 
 
 
384 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  47.34 
 
 
375 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.49 
 
 
388 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  47.61 
 
 
382 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  48.15 
 
 
384 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  48.15 
 
 
384 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  48.41 
 
 
384 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  48.15 
 
 
384 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  48.15 
 
 
384 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.34 
 
 
382 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.04 
 
 
384 aa  359  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  47.88 
 
 
384 aa  358  1e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  47.88 
 
 
384 aa  358  1e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  46.81 
 
 
382 aa  357  2e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.21 
 
 
384 aa  357  2e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.21 
 
 
384 aa  357  2e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.93 
 
 
384 aa  356  3e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.93 
 
 
384 aa  356  4e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.93 
 
 
384 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.66 
 
 
384 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.74 
 
 
378 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  48.07 
 
 
384 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.95 
 
 
369 aa  342  8e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.09 
 
 
376 aa  327  2e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  42.4 
 
 
459 aa  284  2e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.77 
 
 
405 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  25.78 
 
 
340 aa  85.9  1e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  27.16 
 
 
463 aa  82.8  9e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.09 
 
 
398 aa  72.8  8e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.61 
 
 
393 aa  65.9  1e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  30.34 
 
 
429 aa  60.8  4e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 
497 aa  58.2  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.05 
 
 
557 aa  53.9  4e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.69 
 
 
439 aa  49.7  9e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  29.55 
 
 
840 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.07 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.73 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.7 
 
 
361 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  26.72 
 
 
821 aa  46.2  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  30.99 
 
 
490 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.38 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  26.27 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.37 
 
 
500 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.53 
 
 
568 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.84 
 
 
428 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.93 
 
 
889 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  30 
 
 
541 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.43 
 
 
453 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  26.67 
 
 
490 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.03 
 
 
612 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.81 
 
 
631 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>