61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1852 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  100 
 
 		 315 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  97.78 
 
 		 315 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  96.83 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  95.53 
 
 		 309 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  67.61 
 
 		 302 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  67.25 
 
 		 302 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  62.87 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  71.32 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  63.42 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  58.5 
 
 		 288 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  51.05 
 
 		 291 aa  295  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  53.78 
 
 		 281 aa  285  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  49.1 
 
 		 282 aa  272  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  50.39 
 
 		 270 aa  268  7e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  50.39 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  48.67 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  46.79 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  46.98 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  48 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  48.18 
 
 		 279 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  45.59 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  49.06 
 
 		 303 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  49.41 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  49.59 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  45.77 
 
 		 279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  44.21 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  46.91 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  45.11 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  44.2 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  42.91 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  40 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  44.53 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  43.37 
 
 		 282 aa  225  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  44.06 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  44.44 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  38.38 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  41.3 
 
 		 272 aa  216  5e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  39.38 
 
 		 284 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  39.49 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  39.86 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  39.49 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  41.43 
 
 		 269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  40 
 
 		 272 aa  205  9e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  38.31 
 
 		 275 aa  202  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  39.1 
 
 		 266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  37.36 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  39.37 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  34.98 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  26.37 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  26.52 
 
 		 845 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  27.16 
 
 		 828 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  24.4 
 
 		 825 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  27.75 
 
 		 882 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  26.57 
 
 		 831 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  29.63 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  28.32 
 
 		 864 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.48 
 
 		 552 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  29.5 
 
 		 833 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  35.53 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  27.54 
 
 		 833 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  26.06 
 
 		 847 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>