157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1781 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01752  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  85.38 
 
 
602 aa  1098    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1859  putative serine protein kinase, PrkA  84.01 
 
 
644 aa  1157    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00683422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0397  putative serine protein kinase, PrkA  78.23 
 
 
640 aa  1061    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2334  putative serine protein kinase, PrkA  63.55 
 
 
650 aa  888    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.562553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3485  hypothetical protein  82.76 
 
 
644 aa  1135    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2882  serine protein kinase  96.74 
 
 
644 aa  1302    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0547  hypothetical protein  76.52 
 
 
640 aa  1046    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2507  serine kinase family protein  84.01 
 
 
644 aa  1157    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.106478  normal  0.925793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2208  putative PrkA serine protein kinase  82.45 
 
 
644 aa  1135    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0189439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2561  putative serine protein kinase, PrkA  64.64 
 
 
647 aa  890    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105653  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2856  hypothetical protein  75.04 
 
 
643 aa  1022    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2725  hypothetical protein  75.04 
 
 
643 aa  1022    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4631  PrkA serine kinase  77.14 
 
 
640 aa  1051    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3553  putative serine protein kinase, PrkA  73.76 
 
 
640 aa  1007    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1232  putative Serine protein kinase, PrkA  75.52 
 
 
639 aa  1008    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2025  protein kinase  73.14 
 
 
640 aa  1008    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0176  putative serine protein kinase, PrkA  64.64 
 
 
648 aa  891    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5139  putative Serine protein kinase, PrkA  77.45 
 
 
640 aa  1034    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4751  putative serine protein kinase, PrkA  73.6 
 
 
640 aa  992    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.734625  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2257  putative serine protein kinase, PrkA  72.52 
 
 
640 aa  1001    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112487  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0032  putative serine protein kinase, PrkA  62.42 
 
 
648 aa  878    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.177761  normal  0.217338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1890  serine protein kinase, PrkA  83.85 
 
 
644 aa  1159    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.141906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2469  protein kinase  73.29 
 
 
640 aa  995    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1379  serine protein kinase, PrkA  83.85 
 
 
644 aa  1159    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.392186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2050  putative serine protein kinase, PrkA  72.05 
 
 
640 aa  1007    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2217  putative serine protein kinase, PrkA  74.84 
 
 
640 aa  1035    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0733  putative serine protein kinase, PrkA  76.98 
 
 
640 aa  1036    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2157  putative serine protein kinase, PrkA  72.05 
 
 
640 aa  992    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2005  putative Serine protein kinase, PrkA  72.52 
 
 
640 aa  1001    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329127  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1638  PrkA AAA  91.61 
 
 
644 aa  1250    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0647846  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0881  putative serine protein kinase, PrkA  75.27 
 
 
640 aa  1024    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0976  putative serine protein kinase, PrkA  61.78 
 
 
649 aa  845    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3904  putative serine protein kinase  72.83 
 
 
640 aa  1006    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0532  putative serine protein kinase, PrkA  65.58 
 
 
644 aa  888    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.374476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1133  putative serine protein kinase, PrkA  73.76 
 
 
640 aa  996    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1394  putative serine protein kinase, PrkA  80.9 
 
 
640 aa  1095    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0255  putative serine protein kinase, PrkA  64.12 
 
 
649 aa  877    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2910  hypothetical protein  68.38 
 
 
644 aa  936    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7069  putative serine protein kinase, PrkA  64.33 
 
 
650 aa  897    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1646  putative serine protein kinase, PrkA  97.36 
 
 
644 aa  1308    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00357576  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1221  putative serine protein kinase, PrkA  63.76 
 
 
648 aa  889    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.229605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1746  putative serine protein kinase, PrkA  90.37 
 
 
644 aa  1234    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00635815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1510  putative serine protein kinase, PrkA  73.14 
 
 
640 aa  991    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292575  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07680  hypothetical protein  76.98 
 
 
640 aa  1025    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.115546 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1613  putative serine protein kinase, PrkA  73.76 
 
 
640 aa  996    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160164  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1638  putative serine protein kinase, PrkA  97.05 
 
 
644 aa  1304    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112496  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1528  putative serine protein kinase, PrkA  73.14 
 
 
640 aa  991    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629451  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1921  putative serine protein kinase, PrkA  91.61 
 
 
644 aa  1250    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0693234  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2704  putative serine protein kinase, PrkA  74.96 
 
 
640 aa  1021    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3056  putative serine protein kinase, PrkA  74.65 
 
 
640 aa  1011    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.651845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2387  putative serine protein kinase, PrkA  72.83 
 
 
640 aa  996    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203213  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1691  PrkA serine kinase  73.14 
 
 
640 aa  1008    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1693  putative serine protein kinase, PrkA  63.71 
 
 
648 aa  895    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3779  hypothetical protein  73.76 
 
 
640 aa  1023    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146351 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0347  serine protein kinase  73.14 
 
 
640 aa  1008    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1781  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 
644 aa  1334    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000025136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1861  serine protein kinase  73.14 
 
 
640 aa  1008    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1873  serine protein kinase  73.14 
 
 
640 aa  1008    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0814  protein kinase  73.14 
 
 
640 aa  1008    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1833  putative serine protein kinase, PrkA  90.68 
 
 
644 aa  1232    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593259  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2525  putative serine protein kinase, PrkA  68.38 
 
 
644 aa  936    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1671  putative serine protein kinase, PrkA  84.01 
 
 
644 aa  1155    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.860121  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1686  putative serine protein kinase, PrkA  97.36 
 
 
644 aa  1304    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4017  putative serine protein kinase, PrkA  77.14 
 
 
640 aa  1054    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1463  hypothetical protein  85.25 
 
 
644 aa  1166    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1229  putative serine protein kinase, PrkA  72.98 
 
 
640 aa  986    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.237097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6314  hypothetical protein  65.98 
 
 
580 aa  828    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192005  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0431  putative serine protein kinase, PrkA  78.23 
 
 
640 aa  1061    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219182  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1396  serine protein kinase PrkA  83.85 
 
 
644 aa  1159    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1027  putative serine protein kinase, PrkA  63.96 
 
 
649 aa  867    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00228838  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0731  hypothetical protein  77.29 
 
 
640 aa  1026    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1774  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 
644 aa  1334    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000263384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2504  putative serine protein kinase, PrkA  99.84 
 
 
644 aa  1332    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000566164  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2020  putative serine protein kinase, PrkA  63.55 
 
 
650 aa  888    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1991  PrkA serine protein kinase  83.54 
 
 
644 aa  1146    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1412  serine protein kinase, PrkA  83.85 
 
 
644 aa  1159    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.405846  normal  0.417288 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01541  hypothetical protein  84.47 
 
 
644 aa  1165    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1869  serine kinase family protein  84.01 
 
 
644 aa  1157    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.183837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2007  serine kinase family protein  84.01 
 
 
644 aa  1157    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2446  putative serine protein kinase, PrkA  90.37 
 
 
644 aa  1226    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0901471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2731  putative serine protein kinase, PrkA  83.54 
 
 
644 aa  1144    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53743  hitchhiker  0.000511226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1962  putative serine protein kinase, PrkA  90.06 
 
 
644 aa  1231    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.771763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02751  putative serine protein kinase, PrkA  81.83 
 
 
640 aa  1120    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1818  putative serine protein kinase, PrkA  99.84 
 
 
644 aa  1332    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0125883  normal  0.345668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2327  putative serine protein kinase, PrkA  71.43 
 
 
640 aa  979    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0509152  normal  0.762867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1625  putative serine protein kinase, PrkA  73.6 
 
 
640 aa  1014    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2354  hypothetical protein  83.54 
 
 
644 aa  1146    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000221978  normal  0.266981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2059  serine protein kinase domain-containing protein  63.55 
 
 
650 aa  889    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292149  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2567  putative serine protein kinase, PrkA  73.6 
 
 
640 aa  1027    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0428  putative serine protein kinase, PrkA  78.38 
 
 
640 aa  1064    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0371656  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2071  serine protein kinase, PrkA  83.85 
 
 
644 aa  1159    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000277394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2100  putative serine protein kinase, PrkA  83.54 
 
 
644 aa  1146    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00284243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1849  putative serine protein kinase, PrkA  84.01 
 
 
644 aa  1157    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159984  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1408  serine kinase family protein  84.01 
 
 
644 aa  1157    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0526547  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4805  putative serine protein kinase, PrkA  78.07 
 
 
640 aa  1058    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3963  putative serine protein kinase, PrkA  63.55 
 
 
650 aa  887    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2158  putative serine protein kinase, PrkA  90.06 
 
 
644 aa  1228    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.480144  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1589  putative serine protein kinase, PrkA  73.6 
 
 
640 aa  995    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6236  putative serine protein kinase, PrkA  63.55 
 
 
648 aa  892    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283326  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0199  putative serine protein kinase, PrkA  71.43 
 
 
640 aa  976    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.392588 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>