More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1761 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  100 
 
 
246 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  97.15 
 
 
246 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  97.97 
 
 
246 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  97.97 
 
 
246 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  90.42 
 
 
247 aa  417  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  69.87 
 
 
231 aa  343  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  68.2 
 
 
231 aa  340  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  69.04 
 
 
231 aa  340  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  67.78 
 
 
231 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  55.19 
 
 
226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  62.73 
 
 
221 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  57.09 
 
 
237 aa  268  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  57.2 
 
 
222 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  56.05 
 
 
231 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  58.16 
 
 
230 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  52.99 
 
 
236 aa  251  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  51.93 
 
 
226 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  51.5 
 
 
226 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  51.05 
 
 
226 aa  234  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  50.64 
 
 
226 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  51.5 
 
 
226 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  49.36 
 
 
226 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  50.21 
 
 
226 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  47.11 
 
 
230 aa  225  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  49.17 
 
 
231 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  49.37 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  47.35 
 
 
237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  44.64 
 
 
235 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  49.79 
 
 
228 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  41.67 
 
 
227 aa  198  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  45.8 
 
 
228 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  47.75 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  42.37 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  49.79 
 
 
228 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  46.61 
 
 
225 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  42.08 
 
 
228 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  46.61 
 
 
225 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  47.03 
 
 
225 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  48.03 
 
 
233 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  46.61 
 
 
225 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  46.61 
 
 
225 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  46.61 
 
 
225 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  44.68 
 
 
226 aa  191  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  46.19 
 
 
225 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  46.19 
 
 
225 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  46.19 
 
 
225 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  46.53 
 
 
234 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  44.96 
 
 
226 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  44.12 
 
 
287 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  44.77 
 
 
230 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  44.77 
 
 
228 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  44.35 
 
 
228 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  44.35 
 
 
228 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  40.82 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  43.93 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  45.95 
 
 
240 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  45.95 
 
 
245 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  40 
 
 
227 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  45.5 
 
 
240 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  44.44 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  41.1 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  42.49 
 
 
227 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  44.21 
 
 
221 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  41.2 
 
 
222 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  41.2 
 
 
222 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  40.68 
 
 
226 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  41.67 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  41 
 
 
221 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  41.39 
 
 
245 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  39.15 
 
 
223 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  41.8 
 
 
247 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  40.93 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  42.73 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  39.82 
 
 
230 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  42.27 
 
 
226 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  41.49 
 
 
237 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  39.51 
 
 
221 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1920  putative dithiobiotin synthetase  38.59 
 
 
231 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  39.24 
 
 
225 aa  160  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  42.53 
 
 
238 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  38.87 
 
 
239 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  37.76 
 
 
226 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1850  putative dithiobiotin synthetase  37.97 
 
 
231 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1600  putative dithiobiotin synthetase  37.97 
 
 
231 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0959  dethiobiotin synthase  40.68 
 
 
236 aa  158  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  39.15 
 
 
221 aa  158  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1683  putative dithiobiotin synthetase  37.97 
 
 
231 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.809322  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1591  putative dithiobiotin synthetase  37.97 
 
 
231 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0571345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1659  putative dithiobiotin synthetase  37.97 
 
 
231 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2597  dethiobiotin synthase  39.27 
 
 
263 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.204799  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  40.08 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1778  putative dithiobiotin synthetase  36.91 
 
 
231 aa  154  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1608  putative dithiobiotin synthetase  36.91 
 
 
231 aa  154  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1799  putative dithiobiotin synthetase  36.91 
 
 
231 aa  154  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  37.8 
 
 
254 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01562  predicted dethiobiotin synthetase  36.48 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2037  putative dithiobiotin synthetase  36.48 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  40.27 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1667  putative dithiobiotin synthetase  36.48 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>