192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1644 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  100 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  98.06 
 
 
206 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  98.54 
 
 
206 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  97.09 
 
 
206 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  95.63 
 
 
206 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  94.69 
 
 
207 aa  351  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  94.2 
 
 
207 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  94.2 
 
 
207 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  87.44 
 
 
207 aa  339  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  87.86 
 
 
206 aa  321  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  81.95 
 
 
207 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  86.89 
 
 
206 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  80.58 
 
 
206 aa  305  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  81.07 
 
 
206 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  83.01 
 
 
206 aa  300  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  79.41 
 
 
205 aa  291  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  57.43 
 
 
203 aa  210  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  54.19 
 
 
204 aa  202  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  57.58 
 
 
131 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  40.19 
 
 
207 aa  148  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  46.15 
 
 
219 aa  144  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  38.16 
 
 
206 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  38 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  37.68 
 
 
206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  35.75 
 
 
203 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  37.63 
 
 
206 aa  121  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  35.27 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  36.87 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  36.87 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  36.87 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  39.59 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  36.36 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  36.23 
 
 
203 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  36.23 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  32.88 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  43.82 
 
 
368 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  33.17 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  45.35 
 
 
370 aa  88.2  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  47.73 
 
 
392 aa  88.2  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  42.35 
 
 
369 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  45.45 
 
 
363 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  31.88 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  45.88 
 
 
369 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  43.9 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  41.76 
 
 
405 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  44.19 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  44.19 
 
 
370 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  45.98 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  35.65 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  38.38 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  27.62 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  36 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  46.43 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  36.26 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  39.08 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  39.29 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  44.19 
 
 
404 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  52.31 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  46.48 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  37.78 
 
 
397 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  29.65 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  40.7 
 
 
417 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  27.88 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  36.78 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  37.5 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  35.63 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  28.5 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  28.44 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  32.94 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  36.36 
 
 
371 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  33.33 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  32.94 
 
 
458 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  40.54 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  34.88 
 
 
277 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  34.74 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  28.1 
 
 
259 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  35.23 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  31.58 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  31.46 
 
 
391 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  35.14 
 
 
342 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  31.82 
 
 
238 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  36.25 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  29.85 
 
 
248 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  30.1 
 
 
209 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  37.31 
 
 
260 aa  58.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  35.53 
 
 
390 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  34.52 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  27.17 
 
 
582 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  34.62 
 
 
110 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  33.33 
 
 
115 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  33.72 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  32.14 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  32.93 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  32.14 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  36.51 
 
 
371 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  32.14 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  32.93 
 
 
243 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  32.93 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  39.06 
 
 
462 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  32.93 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>