More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1633 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 938 aa  1908    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 964 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 907 aa  426  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 965 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 940 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 937 aa  399  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 944 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 869 aa  386  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 935 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 935 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 935 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 966 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  32.46 
 
 		 936 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 930 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 951 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 930 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 933 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 930 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 966 aa  383  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 957 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  31.89 
 
 		 966 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 951 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 873 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 907 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 948 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 873 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 947 aa  365  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 897 aa  357  5.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 843 aa  357  8.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 981 aa  356  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 946 aa  355  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 841 aa  350  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 904 aa  344  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 904 aa  344  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 904 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 842 aa  337  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 1007 aa  336  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 1007 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 969 aa  335  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 935 aa  335  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 855 aa  334  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 904 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 836 aa  330  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 817 aa  330  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1007 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  29.27 
 
 		 1007 aa  327  7e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 924 aa  325  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 838 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 912 aa  325  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 967 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 853 aa  321  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 855 aa  320  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.55 
 
 		 853 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 853 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 853 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 853 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 987 aa  313  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.15 
 
 		 884 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 939 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 901 aa  303  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  28.94 
 
 		 839 aa  302  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 981 aa  302  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 966 aa  301  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 975 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.7 
 
 		 929 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 883 aa  297  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 883 aa  297  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 952 aa  297  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 924 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 924 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 924 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 953 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 883 aa  295  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 935 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 944 aa  292  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1015 aa  290  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 976 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 976 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 920 aa  281  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 982 aa  281  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 910 aa  277  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  30.84 
 
 		 709 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.76 
 
 		 961 aa  271  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 974 aa  270  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 891 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 875 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 		 895 aa  261  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 852 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 985 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 1020 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 869 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 896 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.21 
 
 		 914 aa  254  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  26.67 
 
 		 899 aa  253  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.52 
 
 		 969 aa  251  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 973 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 855 aa  245  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 861 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 861 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 861 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>