108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1590 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  84.29 
 
 
731 aa  1243  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  58.89 
 
 
738 aa  853  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  83.47 
 
 
731 aa  1251  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.84393e-06  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  99.32 
 
 
730 aa  1508  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  61.01 
 
 
724 aa  913  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  70.16 
 
 
725 aa  1085  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  88.9 
 
 
724 aa  1332  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.33685e-05  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  70.83 
 
 
729 aa  1082  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  68.56 
 
 
727 aa  1067  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  65.25 
 
 
720 aa  963  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  57.03 
 
 
741 aa  846  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  4.2193e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  68.03 
 
 
722 aa  1011  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  99.73 
 
 
730 aa  1511  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.96014e-05  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  74.9 
 
 
735 aa  1113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  100 
 
 
730 aa  1515  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.52412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  52.27 
 
 
745 aa  766  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  67.04 
 
 
719 aa  1009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  36.91 
 
 
729 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  2.80036e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  36.81 
 
 
745 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  36.11 
 
 
716 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  36.48 
 
 
822 aa  210  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  39.47 
 
 
843 aa  199  2e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  8.08171e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  27.11 
 
 
788 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  25.52 
 
 
778 aa  185  2e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  26.83 
 
 
757 aa  184  5e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  37.9 
 
 
833 aa  183  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  26.22 
 
 
789 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  26.34 
 
 
789 aa  181  5e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  26.31 
 
 
788 aa  174  4e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.71 
 
 
639 aa  174  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  26.71 
 
 
639 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.58979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  26.82 
 
 
639 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  26.25 
 
 
639 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  26.86 
 
 
639 aa  158  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  26.41 
 
 
639 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  26.54 
 
 
639 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  26.08 
 
 
639 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  4.44921e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  25.33 
 
 
650 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  25.33 
 
 
650 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25.59 
 
 
650 aa  143  1e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.98 
 
 
650 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.05402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  26.26 
 
 
650 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.35795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  25.2 
 
 
650 aa  138  3e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  7.31399e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  26.09 
 
 
639 aa  138  3e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  25.72 
 
 
646 aa  136  2e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  25.82 
 
 
656 aa  128  4e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  23.33 
 
 
667 aa  119  2e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.045e-05  hitchhiker  6.06277e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  23.85 
 
 
640 aa  115  2e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  24.57 
 
 
639 aa  114  4e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  28.08 
 
 
898 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  24.62 
 
 
663 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  28.16 
 
 
898 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  28.4 
 
 
898 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  29.24 
 
 
826 aa  104  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  30.25 
 
 
741 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  26.12 
 
 
782 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  25.87 
 
 
820 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.17 
 
 
762 aa  94.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  22.18 
 
 
655 aa  94.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.33 
 
 
653 aa  94.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.71 
 
 
671 aa  91.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.01 
 
 
731 aa  90.5  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  23.81 
 
 
766 aa  90.1  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  23.85 
 
 
671 aa  88.6  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  24.45 
 
 
656 aa  87  1e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.37992e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.43 
 
 
764 aa  84.3  8e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  31.9 
 
 
742 aa  80.1  1e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  32.29 
 
 
742 aa  77  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  26.49 
 
 
809 aa  77.4  1e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  23.31 
 
 
785 aa  76.3  2e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  27.53 
 
 
742 aa  75.9  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.1 
 
 
770 aa  75.5  3e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  23.7 
 
 
657 aa  73.6  1e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  22.98 
 
 
755 aa  71.2  7e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  23.54 
 
 
660 aa  70.5  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.88 
 
 
885 aa  69.3  2e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.76 
 
 
754 aa  66.6  1e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  22.01 
 
 
816 aa  64.3  7e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  23.32 
 
 
696 aa  63.9  9e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  24.22 
 
 
945 aa  60.8  7e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  22.89 
 
 
765 aa  60.1  1e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.49 
 
 
895 aa  59.7  2e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  23.03 
 
 
696 aa  59.3  3e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  27.14 
 
 
1111 aa  55.8  3e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  24.44 
 
 
893 aa  55.8  3e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  30.05 
 
 
700 aa  55.8  3e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  21.92 
 
 
764 aa  55.1  4e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  24.66 
 
 
701 aa  54.3  7e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  24.66 
 
 
701 aa  54.7  7e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  24.66 
 
 
701 aa  54.3  8e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  26.94 
 
 
642 aa  53.1  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  24.43 
 
 
698 aa  52.8  3e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  26.96 
 
 
680 aa  52.8  3e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  24.8 
 
 
936 aa  52.4  3e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.1 
 
 
758 aa  51.2  7e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  21.73 
 
 
714 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  4.68411e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  26.23 
 
 
762 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  6.43351e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  23.91 
 
 
761 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.91 
 
 
761 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  27.17 
 
 
655 aa  49.3  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>