More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1584 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  98.67 
 
 
376 aa  777  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  100 
 
 
376 aa  789  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  98.4 
 
 
376 aa  778  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  98.67 
 
 
376 aa  780  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  35.39 
 
 
411 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  34.29 
 
 
397 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  33.94 
 
 
384 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  33.94 
 
 
384 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  34.25 
 
 
393 aa  184  2e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  30.1 
 
 
451 aa  165  1e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  30.1 
 
 
451 aa  163  5e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  29.84 
 
 
451 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  30.1 
 
 
456 aa  159  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  30.9 
 
 
388 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  28.12 
 
 
434 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.03 
 
 
379 aa  141  2e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  27.11 
 
 
467 aa  135  2e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.75 
 
 
402 aa  132  1e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  27.18 
 
 
444 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  26.23 
 
 
400 aa  122  1e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  26.11 
 
 
399 aa  122  1e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  26.2 
 
 
401 aa  121  2e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.88668e-10  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  26.2 
 
 
401 aa  121  2e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.08 
 
 
400 aa  117  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  9.71423e-06 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  26.83 
 
 
451 aa  117  4e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  25.74 
 
 
452 aa  116  8e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  25.07 
 
 
399 aa  114  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.68 
 
 
401 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  24.87 
 
 
400 aa  112  1e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  24.87 
 
 
400 aa  112  1e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  24.42 
 
 
400 aa  111  2e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  25.85 
 
 
451 aa  111  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.98 
 
 
452 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  24.24 
 
 
400 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  25.39 
 
 
412 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.19 
 
 
463 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  28.57 
 
 
420 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  24.94 
 
 
451 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  24.16 
 
 
399 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.81 
 
 
430 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  23.9 
 
 
399 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  23.85 
 
 
399 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  23.82 
 
 
415 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  23.82 
 
 
415 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  27.23 
 
 
422 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.54 
 
 
406 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  28.57 
 
 
482 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  25.18 
 
 
432 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  27.36 
 
 
429 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.5 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  28.46 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.93 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  24.87 
 
 
443 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  30.43 
 
 
242 aa  81.3  3e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.6 
 
 
337 aa  80.9  4e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.75 
 
 
421 aa  80.9  4e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.44 
 
 
337 aa  80.1  6e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.39 
 
 
443 aa  79.3  1e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.43 
 
 
413 aa  78.2  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.5 
 
 
413 aa  78.2  2e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.88 
 
 
404 aa  77.4  4e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  22.88 
 
 
500 aa  77  5e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.61 
 
 
397 aa  77  6e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  25.14 
 
 
377 aa  74.7  2e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.71 
 
 
381 aa  72.4  1e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.21 
 
 
427 aa  71.6  2e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  24.28 
 
 
409 aa  71.6  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  23.99 
 
 
351 aa  71.2  3e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22.97 
 
 
414 aa  70.9  3e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.97 
 
 
414 aa  70.5  4e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  24.73 
 
 
367 aa  70.9  4e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.59 
 
 
373 aa  70.1  6e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.09 
 
 
401 aa  70.1  6e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.11 
 
 
326 aa  70.1  7e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  28.27 
 
 
425 aa  69.3  9e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  7.07551e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  25.95 
 
 
449 aa  69.3  1e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  23.75 
 
 
351 aa  68.9  1e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.5 
 
 
412 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  23.73 
 
 
387 aa  69.3  1e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.06 
 
 
417 aa  68.2  2e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.92 
 
 
361 aa  68.9  2e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  21.93 
 
 
417 aa  67.8  3e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.75 
 
 
378 aa  67.8  3e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  24.2 
 
 
347 aa  67.8  3e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  24.2 
 
 
347 aa  67.8  3e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.84 
 
 
357 aa  67.8  3e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.32 
 
 
368 aa  67.8  3e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  29.02 
 
 
374 aa  67.4  4e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  22.35 
 
 
433 aa  67  5e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.65 
 
 
414 aa  67  5e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.51 
 
 
400 aa  66.6  6e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28.5 
 
 
375 aa  66.6  7e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  23.5 
 
 
394 aa  66.2  8e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  23.42 
 
 
393 aa  66.2  9e-10  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.41 
 
 
379 aa  66.2  9e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  22.83 
 
 
386 aa  65.5  1e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  28.05 
 
 
374 aa  65.9  1e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  26.56 
 
 
415 aa  65.9  1e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.58235e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  23.45 
 
 
415 aa  65.5  1e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  23.47 
 
 
453 aa  65.9  1e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>