More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0632 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  97.8 
 
 		 410 aa  751    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  807    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  65.47 
 
 		 398 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  66.32 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  64.68 
 
 		 407 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  59.8 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  61.52 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  59.64 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  59.17 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  61.85 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  62.7 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  61.71 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  62.12 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  60.58 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  60.58 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  53.03 
 
 		 404 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  55.87 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  57.56 
 
 		 409 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  60.52 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  51.38 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  53.45 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  54.64 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  54.95 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  54.09 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  54.35 
 
 		 402 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  50.41 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  47.61 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  47.66 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  38.83 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 413 aa  272  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  47.25 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 412 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  39.19 
 
 		 451 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  39.19 
 
 		 451 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  39.19 
 
 		 451 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  39.19 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  39.19 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  42.5 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  39.19 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  42.94 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 408 aa  262  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 401 aa  239  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 397 aa  209  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  32.88 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  32 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  35.98 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  32.79 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 399 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 394 aa  166  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  32.72 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 735 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  29.49 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  28.02 
 
 		 409 aa  143  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  29.57 
 
 		 410 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  29.34 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  29.89 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  28.77 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  29.78 
 
 		 419 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  28.81 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  29.1 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  33.46 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  28.83 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  29 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  29.46 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  25.33 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  28.93 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  27.23 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>