More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0521 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  99.5 
 
 
549 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  99.5 
 
 
549 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  99.5 
 
 
549 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
200 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  94 
 
 
550 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  93.5 
 
 
551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  93.5 
 
 
551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  89.85 
 
 
547 aa  386  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  86.5 
 
 
540 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  85.93 
 
 
533 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  87.88 
 
 
538 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  85.35 
 
 
547 aa  370  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  83.76 
 
 
544 aa  364  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  70.05 
 
 
534 aa  313  9e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  68.88 
 
 
561 aa  310  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  67.5 
 
 
532 aa  302  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  67 
 
 
563 aa  301  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  68.37 
 
 
292 aa  299  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  55.5 
 
 
531 aa  250  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  55 
 
 
494 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  49.49 
 
 
276 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  47.98 
 
 
279 aa  208  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  45.69 
 
 
275 aa  205  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  47.94 
 
 
277 aa  205  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  47.74 
 
 
270 aa  204  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  44.62 
 
 
280 aa  204  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  49.74 
 
 
275 aa  202  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  45.92 
 
 
279 aa  198  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  45.73 
 
 
283 aa  191  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  42.05 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  43.59 
 
 
275 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  46.7 
 
 
279 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  43.52 
 
 
276 aa  184  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  40.51 
 
 
286 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  43 
 
 
283 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  44.22 
 
 
279 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  42.71 
 
 
275 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  42.05 
 
 
274 aa  181  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  39.49 
 
 
287 aa  178  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  41.12 
 
 
275 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  44.15 
 
 
276 aa  178  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  39.49 
 
 
288 aa  177  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  44.39 
 
 
280 aa  176  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  41.24 
 
 
275 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  41.24 
 
 
275 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  40.72 
 
 
275 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  41.15 
 
 
268 aa  176  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  40.21 
 
 
270 aa  176  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  38.97 
 
 
274 aa  175  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  40.21 
 
 
275 aa  174  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  41.24 
 
 
277 aa  174  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  40.72 
 
 
275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  40.21 
 
 
298 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  40.72 
 
 
275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  40.72 
 
 
275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  38.97 
 
 
288 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  40.61 
 
 
276 aa  171  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  41.03 
 
 
274 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  43.62 
 
 
274 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  39.09 
 
 
275 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 
274 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  43.32 
 
 
268 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  40.21 
 
 
275 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  39.9 
 
 
267 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  39.58 
 
 
281 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 
267 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  40.31 
 
 
297 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  39.9 
 
 
278 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 
267 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  39.06 
 
 
288 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  36.41 
 
 
288 aa  164  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.06 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.06 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  37.06 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  36.6 
 
 
286 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  36.6 
 
 
286 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  39.49 
 
 
291 aa  161  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  36.6 
 
 
286 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  36.6 
 
 
286 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  36.08 
 
 
286 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  40.93 
 
 
277 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  35.5 
 
 
286 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  35.5 
 
 
286 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560.2  small-conductance mechanosensitive channel  94.94 
 
 
429 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  35.5 
 
 
291 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  37.24 
 
 
273 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  35.5 
 
 
286 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  35.5 
 
 
286 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  35.5 
 
 
286 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  35.5 
 
 
286 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  35.5 
 
 
286 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  39.8 
 
 
277 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  39.06 
 
 
269 aa  159  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  38.54 
 
 
271 aa  158  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  35.5 
 
 
286 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  40.41 
 
 
275 aa  158  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  38.54 
 
 
271 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  39.69 
 
 
274 aa  157  8e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  39.27 
 
 
291 aa  157  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>