More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0488 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  99.4 
 
 		 335 aa  696    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  698    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  99.1 
 
 		 335 aa  691    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  99.7 
 
 		 335 aa  695    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 320 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  51.59 
 
 		 348 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 333 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  49.06 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 341 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 341 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  48.09 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 330 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  52.24 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  47.94 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  47.94 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  47.45 
 
 		 317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  49.69 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  43.77 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  43.79 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  43.44 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  43.71 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  45.98 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 		 332 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  44.9 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 346 aa  261  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  37.85 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  40.32 
 
 		 331 aa  255  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  43.63 
 
 		 313 aa  255  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  41.14 
 
 		 328 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  38.7 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  40.37 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  41.85 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  39.88 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  38.25 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  37.78 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 342 aa  245  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  40.97 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  39.74 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  40.32 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  41.16 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  38.8 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  40.06 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  39.38 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  37.92 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  40.49 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  39.41 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  42.27 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 		 332 aa  235  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  38.66 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  38.49 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  38.31 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  37.82 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  36.91 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  37.99 
 
 		 324 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  38.59 
 
 		 321 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 332 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  36.59 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  37.61 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  36.66 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  37.66 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.77 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  39.32 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>