130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0486 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  97.97 
 
 
295 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  94.92 
 
 
295 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  94.92 
 
 
295 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  90.85 
 
 
295 aa  558  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  80.61 
 
 
294 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  79.52 
 
 
309 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  80.61 
 
 
292 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  78.16 
 
 
293 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  75.17 
 
 
294 aa  471  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  78.57 
 
 
292 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  75.68 
 
 
257 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  68.69 
 
 
300 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  63.82 
 
 
298 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  63.05 
 
 
297 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  62.03 
 
 
298 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  62.03 
 
 
298 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  58.5 
 
 
296 aa  332  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  95.17 
 
 
156 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  43.66 
 
 
296 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  38.57 
 
 
291 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 
291 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  39.12 
 
 
292 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  43.32 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  40.13 
 
 
293 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 
292 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 
293 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  42.46 
 
 
293 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  40.49 
 
 
293 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  39.86 
 
 
293 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  40.56 
 
 
295 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  40.56 
 
 
295 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 
293 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 
289 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  39.26 
 
 
338 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  38.49 
 
 
293 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  36.05 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.2 
 
 
291 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  35.84 
 
 
291 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  35.79 
 
 
292 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  35.11 
 
 
297 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  31.29 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  35.12 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 
293 aa  139  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  31.75 
 
 
388 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  30.48 
 
 
308 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  34.08 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.1 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 
294 aa  129  6e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
399 aa  128  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 
377 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 
386 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 
373 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 
311 aa  122  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  33.16 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  27.73 
 
 
321 aa  106  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 
390 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  30.18 
 
 
332 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 
409 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 
402 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3496  hypothetical protein  78.38 
 
 
38 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.13 
 
 
448 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.43 
 
 
472 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 
444 aa  52.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 
520 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  28 
 
 
472 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  29.27 
 
 
501 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 
541 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
374 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 
473 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.65 
 
 
484 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 
716 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 
472 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  26.52 
 
 
404 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  23.96 
 
 
401 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 
533 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.21 
 
 
378 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  25.48 
 
 
379 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  26.88 
 
 
715 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3038  radical SAM family Fe-S protein  27.5 
 
 
523 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345739  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.16 
 
 
371 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
705 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  22.92 
 
 
379 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 
531 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3239  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 
513 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0952946  normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  22.92 
 
 
379 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1738  cobalamin B12-binding/radical SAM domain-containing Fe-S oxidoreductase  25.64 
 
 
521 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 
488 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  20.18 
 
 
468 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  25.32 
 
 
553 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 
429 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 
472 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.29 
 
 
448 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 
503 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1716  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.5 
 
 
384 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.871197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>