90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0297 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0297  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00916161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0290  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.710224  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0302  protein of unknown function UPF0057  100 
 
 
55 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390806  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0298  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571873  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0400  hypothetical protein  98.15 
 
 
55 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00797184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0285  hypothetical protein  96.3 
 
 
55 aa  83.6  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.6413e-06  hitchhiker  2.02447e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0285  hypothetical protein  96.3 
 
 
55 aa  83.6  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.102648  unclonable  3.68394e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3736  hypothetical protein  96.3 
 
 
55 aa  83.6  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.727886  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3538  hypothetical protein  89.09 
 
 
55 aa  80.1  1e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0895  hypothetical protein  87.04 
 
 
54 aa  78.6  3e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423  hypothetical protein  92.68 
 
 
41 aa  78.6  3e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0094  hypothetical protein  76.36 
 
 
55 aa  67  8e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001339  plasma membrane protein involved in salt tolerance  53.7 
 
 
54 aa  65.1  3e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.9667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0100  hypothetical protein  89.09 
 
 
55 aa  61.2  4e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00236491  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4389  hypothetical protein  88.89 
 
 
54 aa  60.5  8e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  5.71774e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4780  hypothetical protein  88.89 
 
 
54 aa  60.5  8e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00995444  unclonable  6.98699e-09 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0915  membrane protein  58.82 
 
 
52 aa  58.9  2e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3317  protein of unknown function UPF0057  50.98 
 
 
58 aa  57.8  6e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05228  hypothetical protein  51.85 
 
 
54 aa  57.4  7e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0810  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  56.6  1e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3802  hypothetical protein  55.1 
 
 
52 aa  55.8  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0694  hypothetical protein  54 
 
 
52 aa  55.8  2e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2519  hypothetical protein  56.52 
 
 
52 aa  55.8  2e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0701281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0952  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  53.9  8e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.15986e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3465  hypothetical protein  48.15 
 
 
52 aa  52.8  1e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36994  predicted protein  41.82 
 
 
81 aa  53.5  1e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.384013  normal  0.185346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1940  protein of unknown function UPF0057  48 
 
 
52 aa  52.4  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1909  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  52  3e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0986312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0361  protein of unknown function UPF0057  46 
 
 
58 aa  51.6  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869004  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1824  hypothetical protein  45.1 
 
 
56 aa  51.2  5e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3436  protein of unknown function UPF0057  43.14 
 
 
54 aa  50.8  5e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668514  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1445  hypothetical protein  46 
 
 
52 aa  50.8  6e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.344873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1072  hypothetical protein  40.74 
 
 
57 aa  50.8  7e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0505681  hitchhiker  8.34558e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2734  hypothetical protein  46.81 
 
 
52 aa  50.4  8e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3915  hypothetical protein  42 
 
 
55 aa  50.4  8e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.932934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3564  protein of unknown function UPF0057  44.9 
 
 
54 aa  50.4  9e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.295411  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3240  hypothetical protein  44.9 
 
 
54 aa  50.4  9e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.696832  normal  0.0916248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1531  hypothetical protein  58.97 
 
 
58 aa  50.1  1e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647152 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45467  predicted protein  36.54 
 
 
144 aa  48.9  2e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.564065  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1753  Pmp3 family protein  44 
 
 
52 aa  48.9  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  8.04754e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0373  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  48.9  3e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.485112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0403  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  48.9  3e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5980  stress induced protein  46.3 
 
 
52 aa  48.9  3e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3187  hypothetical protein  44 
 
 
52 aa  48.5  3e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00459993  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31254  predicted protein  51.16 
 
 
52 aa  48.1  4e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1858  hypothetical protein  41.18 
 
 
57 aa  47.8  5e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208589 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3147  hypothetical protein  52.17 
 
 
52 aa  47.8  5e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.86244e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1757  protein of unknown function UPF0057  48.98 
 
 
52 aa  47.4  6e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02522  predicted membrane protein  50 
 
 
52 aa  47.4  7e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1040  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  47.4  7e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2786  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  47.4  7e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.313284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1017  protein of unknown function UPF0057  50 
 
 
52 aa  47.4  7e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02486  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  47.4  7e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3712  protein of unknown function UPF0057  51.28 
 
 
53 aa  47.4  7e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2905  protein of unknown function UPF0057  42.31 
 
 
54 aa  47.4  7e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2946  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  47.4  7e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2801  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  47.4  7e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3908  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  47.4  7e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3215  protein of unknown function UPF0057  42.31 
 
 
54 aa  47.4  7e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3215  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  47.4  7e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5163  hypothetical protein  47.83 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6707  protein of unknown function UPF0057  44.44 
 
 
52 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570236  normal  0.473948 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02312  stress response RCI peptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10590)  42.31 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000114001  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2651  hypothetical protein  48.72 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02650  hypothetical protein  53.85 
 
 
51 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0507  hypothetical protein  40 
 
 
53 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4676  hypothetical protein  40 
 
 
53 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  7.47615e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2368  hypothetical protein  47.83 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00768367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2121  hypothetical protein  47.83 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136692  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01010  cation transport-related protein, putative  49.02 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.249867  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3098  hypothetical protein  43.48 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2107  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.821113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2184  hypothetical protein  45.65 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4140  hypothetical protein  43.59 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2446  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.17765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2909  hypothetical protein  43.48 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2310  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2993  hypothetical protein  43.48 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.761732  normal  0.0250059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2976  hypothetical protein  43.48 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318311  normal  0.0724443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2941  hypothetical protein  43.48 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0778428 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2343  hypothetical protein  45.65 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2363  hypothetical protein  45.65 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0887  hypothetical protein  41.18 
 
 
55 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4829  hypothetical protein  45 
 
 
52 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.658257  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2151  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.241708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3015  hypothetical protein  45.65 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.712573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0399  hypothetical protein  45 
 
 
52 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.350701  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1257  hypothetical protein  46.15 
 
 
52 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0670  hypothetical protein  43.59 
 
 
52 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07370  hypothetical protein  43.59 
 
 
52 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>