165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0251 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0251  flavocytochrome c  100 
 
 		 161 aa  324  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  97.04 
 
 		 506 aa  266  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  94.07 
 
 		 506 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  86.67 
 
 		 506 aa  245  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  85.93 
 
 		 506 aa  243  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  80.74 
 
 		 506 aa  216  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  81.48 
 
 		 506 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  81.48 
 
 		 506 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  82.22 
 
 		 506 aa  203  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  49.26 
 
 		 500 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  44 
 
 		 499 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  52.78 
 
 		 494 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  46.15 
 
 		 505 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  45.11 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  39.33 
 
 		 500 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  43.85 
 
 		 503 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  45.74 
 
 		 519 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.97 
 
 		 517 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  48.57 
 
 		 506 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  47.62 
 
 		 506 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.75 
 
 		 519 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  41.22 
 
 		 506 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  42.75 
 
 		 521 aa  100  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  43.41 
 
 		 512 aa  98.2  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  41.41 
 
 		 517 aa  97.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  43.94 
 
 		 511 aa  96.7  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  41.26 
 
 		 521 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  41.86 
 
 		 519 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  40.62 
 
 		 517 aa  93.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  36.76 
 
 		 174 aa  90.5  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  41.6 
 
 		 517 aa  86.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  43.09 
 
 		 515 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 511 aa  86.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  39.55 
 
 		 510 aa  84.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  42.71 
 
 		 517 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  37.82 
 
 		 505 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  39.23 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  39.23 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  42.71 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  42.86 
 
 		 481 aa  75.1  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  37.1 
 
 		 507 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  38.93 
 
 		 520 aa  73.9  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.97 
 
 		 584 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 491 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  34.43 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  41.38 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  38.33 
 
 		 598 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  40.79 
 
 		 599 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.93 
 
 		 482 aa  62.4  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  31.25 
 
 		 497 aa  61.6  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  39.02 
 
 		 609 aa  61.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2507  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  44.83 
 
 		 602 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.17 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.8 
 
 		 493 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  35 
 
 		 502 aa  58.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  39.29 
 
 		 491 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20340  putative succinate dehydrogenase  43.75 
 
 		 581 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.78266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  31.82 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.98 
 
 		 457 aa  55.1  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.36 
 
 		 534 aa  54.3  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  38.1 
 
 		 588 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2710  putative succinate dehydrogenase  35.29 
 
 		 568 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228165  normal  0.454137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  35.82 
 
 		 606 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  37.5 
 
 		 577 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2868  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  42.42 
 
 		 558 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  41.03 
 
 		 570 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2727  putative succinate dehydrogenase  38.24 
 
 		 569 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  35.29 
 
 		 605 aa  50.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2150  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34 
 
 		 563 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.357931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2695  putative succinate dehydrogenase  33.75 
 
 		 570 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4011  putative succinate dehydrogenase  38.46 
 
 		 587 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.72 
 
 		 476 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  34.48 
 
 		 601 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3120  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32 
 
 		 562 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6094  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.21 
 
 		 589 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00173054  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.82 
 
 		 598 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  35.82 
 
 		 563 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0805  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.67 
 
 		 471 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2605  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32 
 
 		 562 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.800932  normal  0.0451497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  39.71 
 
 		 578 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  35.82 
 
 		 563 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  35.82 
 
 		 563 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2896  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.05 
 
 		 588 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217438  hitchhiker  0.000124211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  35.82 
 
 		 570 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.71 
 
 		 598 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  34.25 
 
 		 564 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  36.71 
 
 		 596 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.56 
 
 		 510 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  36.26 
 
 		 597 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  36.36 
 
 		 572 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.1 
 
 		 598 aa  47.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  33.82 
 
 		 560 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.71 
 
 		 478 aa  47.8  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  37.8 
 
 		 550 aa  47.4  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.19 
 
 		 564 aa  47.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5492  putative succinate dehydrogenase  37.5 
 
 		 567 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1547  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  35.71 
 
 		 530 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.86 
 
 		 569 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7441  putative FAD-binding dehydrogenase  31.88 
 
 		 598 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  35.44 
 
 		 596 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>