26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0097 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4443  paraquat-inducible protein A  99.53 
 
 
211 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4248  Paraquat-inducible protein A  99.53 
 
 
211 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4303  paraquat-inducible protein A  99.53 
 
 
211 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0097  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
211 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  91.3 
 
 
207 aa  384  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3953  paraquat-inducible protein A  84.36 
 
 
211 aa  346  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3860  paraquat-inducible protein A  84.36 
 
 
211 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4068  hypothetical protein  83.89 
 
 
211 aa  343  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4710  hypothetical protein  82.46 
 
 
230 aa  338  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0138  paraquat-inducible protein A  61.08 
 
 
222 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0101  paraquat-inducible protein A  63.93 
 
 
219 aa  242  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  50 
 
 
188 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0283  hypothetical protein  45.11 
 
 
202 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  42.33 
 
 
203 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  27.18 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  32.22 
 
 
380 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  31.25 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  30.08 
 
 
167 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  39.24 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  35.8 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  36.59 
 
 
449 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  31.4 
 
 
450 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  31.4 
 
 
450 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  31.4 
 
 
415 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3076  Paraquat-inducible protein A  30.25 
 
 
155 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3333  hypothetical protein  27.5 
 
 
162 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>